侯深，神武尖山人。為人機警，頗有膽略。孝明帝末年，六鎮(zhèn)因饑餓發(fā)生變亂，他跟隨杜洛周向南進犯。后來與妻兄念賢一起背叛杜洛周，歸順..朱榮。他們在途中遇到強盜搶劫，只披了塊褐色的布遮擋身子。..朱榮送給他衣服帽子，很優(yōu)厚地對待他，任命他為中軍副都督。孝莊帝即位，封他為厭次縣子。他跟隨..朱榮討伐葛榮，在滏口大戰(zhàn)，立功最多，被朝廷命為燕州刺史。

　　這時，葛榮的別帥韓樓、郝長等人率兵屯據(jù)在薊城，..朱榮命他進攻韓樓，給他的人馬卻很少。有人替他說話，嫌人馬太少，..朱榮卻說：“隨機應變，是侯深的特長。如果讓他帶很多人去，未必能用得上。”所以，只給他七百兵馬。侯深故意虛張聲勢，率領數(shù)百騎兵深入韓樓占領的區(qū)域，離薊城百多里，遇上賊帥陳周率馬步兩軍一萬多人，侯深把敵人打得大敗，俘虜敵兵五千多人。然后將繳獲的馬匹武器又歸還給他們，放他們回薊城，左右的人都勸阻他，他說“：我們的人數(shù)少，不可以以力相拼，事情需要設法離間敵人。”他估計放回的敵兵已回到薊城，便率領騎兵連夜進發(fā)，早晨叩打城門。韓樓果然懷疑降卒要作內應，便棄城逃走，侯深縱兵追趕，將他擒拿。因立功被賜爵為侯，不久被任命為平州刺史，鎮(zhèn)守范陽。

　　..朱榮被殺，太守盧文偉引誘侯深出外打獵，然后關閉城門，不讓他進城。他率領部曲家丁駐扎在南郊，為..朱榮舉喪致哀，然后率兵向南進發(fā)。孝莊帝派東萊王元貴平為大使，慰勞燕、薊一帶的軍隊。侯深詐降，元貴平相信了他。他便將貴平抓獲。軍隊進至中山，行臺仆射魏蘭根向他進攻，被他打敗。東海王元曄即位，授予侯深儀同三司、定州刺史、左軍大都督、漁陽郡公。節(jié)閔帝即位，又加封他為開府。后來，他隨..朱兆在廣阿與高歡對壘，..朱兆敗走。侯深投降高歡，后來與高歡一起在韓陵打敗..朱氏。

　　永熙初年，他被任命為齊州刺史。孝武帝末年，他與兗州刺史樊子鵠、青州刺史、東萊王元貴平之間，書信和使者不斷往來，互相聯(lián)絡。他又派人向高歡表示忠誠。孝武帝西入長安，他對魏室仍存希望。汝陽王元暹任齊州刺史，侯深不按時迎納他進城內，城里的人劉桃符等偷偷將元暹領進城，占據(jù)了城的西部。侯深爭奪，不能獲勝，率領騎兵出逃。他的妻子兒女和家丁都被元暹俘獲。

　　行至廣里，適逢接到皇帝的圣旨，命侯深管理青州政務。高歡也給他送來書信，說：“你不要認為自己軍隊的數(shù)量少，難于向東前進。齊人人情淡薄，齊州人還能迎接汝陽王元暹，青州人難道不能打開城門等待你嗎？”侯深又回來，元暹才歸還他的家丁。而元貴平認為自己是斛斯椿一黨，也不讓他代替。侯深襲擊高陽郡，克復了城池，把家屬和家丁都安置在城中，親自率領精銳騎兵，夜晚馳向青州，城內的人抓住元貴平開城投降。侯深思慮自己多次反復，怕不能得到平安，便殺了元貴平，將他的頭顱傳示鄴地，標明自己不是斛斯椿一黨。

　　樊子鵠被平定后，朝廷下詔命封延之為青州刺史。侯深沒有得到州牧的任職，心里恐慌害怕，行至廣川，便搶劫光州的倉庫造反。他派騎兵到平原，抓住前膠州刺史賈璐，夜晚襲擊青州南面的外部，劫去前任廷尉卿崔光韶以迷惑人心，又攻掠其他州縣。他的部將紛紛背叛了他，他便投奔南梁。行至南青州境內，被賣飯的人殺死，首級傳示鄴城，家里的其他人都被流放。