吳中行，字子道，江蘇武進(jìn)人。父親吳性，哥哥吳可行，都是進(jìn)士。吳性，官至尚寶丞。吳可行，為檢討。吳中行剛剛二十歲時就中了鄉(xiāng)試，吳性告誡他不要急于求進(jìn)士，于是他沒有參加會試。隆慶五年(1571)中進(jìn)士，選為庶吉士，授職編修。

　　大學(xué)士張居正是吳中行考進(jìn)士時的主考官。萬歷五年(1577)，張居正的父親死了，沒有解職回鄉(xiāng)奔喪，仍就執(zhí)掌朝政。御史曾士楚、吏科都給事中陳三謨首先上疏奏請讓他留下，滿朝大臣都隨聲附和，唯獨(dú)吳中行很氣憤。剛好彗星出現(xiàn)在西南方，長度竟達(dá)到天際，皇上下詔讓百官反省。吳中行于是首先上疏說：“張居正父子分處兩地，雙方已有十五年未見面。其父已死于數(shù)千里之外，陛下不讓他星夜奔喪，撫棺慟哭，卻一定要他違心地壓抑感情，忍痛含悲于朝廷之上，并讓他主持政務(wù)，執(zhí)掌權(quán)柄，發(fā)揚(yáng)功業(yè)，為國事操勞，這難道合乎情理嗎？！張居正每每自言他謹(jǐn)守圣賢的義理和祖宗法度。宰我欲將喪期縮短，孔子說：‘宰我有三年的愛心于他的父母嗎？’王子請求服幾個月的喪期，孟子說：‘雖然增加一天已經(jīng)超過了?！ベt的訓(xùn)導(dǎo)怎么樣？在法律上，雖然是老百姓、小官吏，隱匿喪情也是被禁止的，唯有武人得以穿黑色喪服不奔喪事，但這不是處置輔臣的辦法。有人說過去也有起用之事，但也沒有聽說一天都不出京城大門，而立刻就任職的。祖宗的規(guī)矩如何呢？這件事關(guān)系到萬古的綱常，天下的人都會看到、聽到，唯有今天沒有過失的舉動，然后后世才沒有令人遺憾的議論。亟待解決的問題莫過于此?！?br />
　　奏疏已經(jīng)上了，他把副本告訴張居正。張居正驚訝地說：“奏疏送進(jìn)去了嗎？”吳中行說：“沒有送上不敢告訴你?！钡诙欤w用賢的疏奏上。第三天，艾穆、沈思孝的奏也呈上。張居正發(fā)了火，與馮保商量，欲廷杖他們。翰林院侍講趙志皋、張位、于慎行、張一柱、田一雋、李長春，修撰習(xí)孔教、沈懋學(xué)都上奏救他們，但奏疏都被阻止沒有上報。學(xué)士王錫爵于是會同數(shù)十人，找張居正求和解，張不接受。于是廷杖吳中行等四人。第二天，進(jìn)士鄒元標(biāo)上疏爭辯，也被廷杖。這五個人正直的名聲震動天下。吳中行、趙用賢并稱吳、趙。南京御史朱鴻謨上疏救援五人，也被斥責(zé)。吳中行等受了廷杖后，校尉用布將他們拖出長安門，用木板抬著，當(dāng)天就驅(qū)趕出都城。吳中行氣息都沒有了，中書舍人秦柱帶來了醫(yī)生，喂服了一勺子藥，才蘇醒。用車載著他南歸，歸家后，挖出腐肉數(shù)十塊，大的如手掌，深寸許，一肢都挖空了。

　　萬歷九年(1581)全面考核京官，把五人列于考察名單上，將其禁錮不讓任職。張居正死后，曾士楚應(yīng)當(dāng)巡按蘇、松地區(qū)，他慚愧地說：“我有什么面目去見吳、趙二位大人呢！”于是聲稱有病走了。陳三謨已被提為太常少卿，不久與曾士楚都被彈劾而削去職務(wù)。朝廷大臣一起推薦吳中行，下詔起用為原官職，升為右中允，值經(jīng)筵。大學(xué)士許國攻擊李植、江東之，詆毀吳中行、趙用賢是他們一派的。中行上奏辯白，因而乞求回鄉(xiāng)，皇上沒有答應(yīng)，又升為右諭德。御史蔡系周彈劾李植，又提到中行，中行請求免職，上了四道奏章?；噬舷略t賞賜白金、文綺，乘驛馬回去。后來言官屢屢推薦他，執(zhí)掌大權(quán)的人有意抑制，不召他回京城。過了很久，起用為侍講學(xué)士，執(zhí)掌南京翰林院。同里之人僉事徐堂吉曾彈劾吳中行，事情已經(jīng)了結(jié)，給事中王嘉謨又重提舊事彈劾他，朝廷命令他呆在家中等待征召。不久就死了。后贈為禮部右侍郎。