蕭如薰，字季馨，陜西延安衛(wèi)人。萬歷中，由世襲百戶任職寧夏參將，守衛(wèi)平虜城。

　　萬歷二十年(1592)春天，継拜、劉東陽占據(jù)寧夏鎮(zhèn)城反叛，派遣他們的黨徒四出攻城略地。継拜的兒子継承恩攻掠玉泉營，游擊傅桓拒守，被他的部下逮捕。叛賊已經(jīng)進攻中衛(wèi)和廣武，參將熊國臣等棄城逃跑，鄰近各城皆望風而降。叛賊土文秀掠平虜，唯獨蕭如薰堅守不下。蕭如薰的妻子楊氏是前任尚書楊兆的女兒，賢明而足智多謀，支持丈夫死守，每天準備牛肉酒犒勞戰(zhàn)士。継拜的養(yǎng)子継云最為驍勇，引導河套著力兔急攻。蕭如薰在南關設下伏兵，假裝戰(zhàn)敗，引誘叛賊進入伏擊圈，射死継云，余下的叛賊逃跑，他又襲擊著力兔的軍營，奪得大量的人口、牲畜。著力兔氣憤異常，又來進攻，被麻貴擊退，平虜城得以保全。起初，皇上聽說蕭如薰堅守孤城抗擊叛賊，大喜過望，重獎銀幣，提升他為副總兵。六月，蕭如薰以都督僉事任寧夏總兵官，統(tǒng)轄延綏、甘肅、固原各路援軍。這年秋天與李如松等共同平定叛亂，再次提升官職為都督同知，襲錦衣衛(wèi)指揮僉事，妻子楊氏也被旌表。

　　萬歷二十二年(1594)八月，卜失兔西犯定邊，闖入固原要塞，副將姜直無法抵御，卜失兔于是由沙梁破墻而入，直抵下馬關，縱橫內(nèi)地近一個月。蕭如薰被免官，姜直下吏部受審。不久，蕭如薰又以總兵官之職鎮(zhèn)守固原。河套邊寇進犯，蕭如薰擊退了他們。青海的邊寇糾集番族進犯洮、岷，蕭如薰和臨洮總兵孫仁抵御，抓住、斬首共三百四十多人，招撫叛亂的番族五千人，繳獲駱駝、馬匹、甲仗無數(shù)。他又鎮(zhèn)守寧夏。銀定、歹成的人數(shù)次入犯，都將他們挫敗。移鎮(zhèn)薊州。過了很久，被罷官回鄉(xiāng)。后又恢復原官職，鎮(zhèn)守延綏。

　　天啟初年，朝廷議論認為京城的軍隊不夠用，召回邊將分營訓練。蕭如薰統(tǒng)帥神機營?；噬险僖娝?，賜予食物，嘉獎他勞苦功高。第二年出來鎮(zhèn)守徐州。不久，他又被召回京城，再次以總兵官身份鎮(zhèn)守保定。天啟五年(1625)夏天，魏忠賢之流彈劾他與李三才聯(lián)姻，于是遂被奪職務。崇禎初年死去，朝廷按制度予以賞賜、撫恤。

　　蕭如薰作為將領老練持重。歷守七鎮(zhèn)，所到之處受到稱贊。自從隆慶以后，和議互市既成，邊境少有警報，朝臣將邊鎮(zhèn)將領視為外府之官。山人雜流，乞得朝士書信而來的人，沒有不飽其所欲。守薊鎮(zhèn)的戚繼光以詩聞名，尤其好延請文人學士，傾財結納，取給于軍中府庫。蕭如薰也能寫詩，文人學士趨之若鶩，賓客常常滿座。妻子楊氏、繼妻南氏都是貴族家的女兒，到了脫下首飾供給賓客還不能滿足的地步。軍中頗以為苦，蕭如薰不能推辭。一時成為風氣，各邊鎮(zhèn)的物力為之耗減，有識之士沒有不嘆息的。

　　蕭如薰的祖父蕭漢，是涼州的副總兵、都督僉事。父親蕭文奎，京營副將、都督同知。哥哥蕭如蘭，陜西副總兵、都督僉事，前府僉書；蕭如蕙，寧夏總兵官、都督同知；蕭如芷，提督南京教場、都督僉事。