令人費解的是，在與 海上霸主 英國的海戰(zhàn)中，美軍取得了驚人的戰(zhàn)績，其中包括1813年美軍取得的伊利湖戰(zhàn)役和泰晤士河戰(zhàn)役的勝利。美國的私掠船也肆意追捕英國商船，并大獲其利。這些戰(zhàn)役雖不能打破英國的海上優(yōu)勢，卻足以影響英軍的士氣和自信心，打亂其戰(zhàn)略部署。

1814年，美國陸軍也在巴爾的摩港大敗英軍，后又取得普拉斯堡等戰(zhàn)役的勝利。

當美英雙方都已對戰(zhàn)爭感到厭倦之時，和談的大門被打開了。

但談判之路是艱苦漫長的，直至1814年12月，雙方才簽訂了《根特和約》，以維持戰(zhàn)前狀況為條件，結束戰(zhàn)爭。但此時歷史對交戰(zhàn)雙方開了一個玩笑，由于當時通信條件的限制使締約的消息姍姍來遲，1815年1月雙方仍發(fā)生了一場新奧爾良戰(zhàn)役，美軍取得了重大勝利。

當這兩個消息傳到華盛頓時，麥迪遜欣喜若狂。

在這場戰(zhàn)爭期間，美國付出了巨大的物質損失，其中傷亡和失蹤近一萬人。戰(zhàn)爭使美國的國家安全得到了保障并緩和了國內矛盾。戰(zhàn)爭徹底結束了美國在經濟上對英國的依賴，獲得了真正的經濟自主權，同時刺激了國內制造業(yè)的發(fā)展，使美國開始向工業(yè)強國邁進。人們把這場戰(zhàn)爭稱作 第二次獨立戰(zhàn)爭 。這場戰(zhàn)爭還推動了美國的軍事理論和軍隊建設事業(yè)的發(fā)展，鍛煉了一大批優(yōu)秀的軍事指揮人才，其中門羅、安德魯·杰克遜等五位將軍后來分別先后成為共和國總統(tǒng)。

戰(zhàn)爭的結束也使麥迪遜度過了執(zhí)政的危機時期，他的總統(tǒng)任期的最后兩年是在比較平穩(wěn)的情況下度過的。由于在戰(zhàn)爭期間陰謀分裂聯邦，聯邦黨在戰(zhàn)后很快就消亡了，黨派之爭大大緩和。西進運動再掀高潮，促進了經濟的繁榮和社會結構的變化。

1815年，麥迪遜出于對國家安全的考慮，建議大大增加撥款數額，以加強海陸常備軍的建設，要求征收財產稅和保護性關稅。此后，海軍建設的步伐明顯地加快了，對各類商品特別是美國紡織品的保護性關稅增加了。

這時期，麥迪遜調整了他的經濟政策，以便加快美國的工業(yè)化的步伐。1816年，他簽署了《第二銀行法》，以設立新的國家銀行，并通過了關稅條例，提高關稅率，以保護發(fā)展中的民族工商業(yè)。他還對國家的交通運輸和教育事業(yè)給以大力支持，如修建公路、運河，支持籌建公立學校和大學等。幾年之內，美國的國力明顯增長，經濟生活和政治生活的面貌都發(fā)生了巨大變化。

但麥迪遜仍堅持有限政府的原則，反對政府權力的過度膨脹。在卸任前夕，他否決了關于用聯邦資金來改善國內交通運輸的法案，其理論依據便是：必須對憲法予以嚴格解釋，而《聯邦憲法》中并沒授權聯邦政府修筑公路和運河。

麥迪遜遵循了其前任創(chuàng)下的慣例，沒有謀求第三次當選總統(tǒng)，指定詹姆斯·門羅作為他的政治繼承人，競選第5任美國總統(tǒng)。選民們對麥迪遜的政績大力贊揚并大力支持門羅順利當選。

晚年生活卸任后，麥迪遜回到養(yǎng)育了他的蒙彼利埃，決心全面退出政壇。他一面讀書、寫信、會友，一面致力于農場的科學化經營。他要建立一座全國第一流的農場，其目的：一是要使晚年生活過得更加充實，二是要填補幾年來農場經營不善的虧空，另外要償還不爭氣的繼子欠下的債務。

與杰斐遜一樣，麥迪遜對教育事業(yè)十分熱心，贊同并參與創(chuàng)建弗吉尼亞大學，出任該校董事會的董事，杰斐遜去世后接任該校校長。與此同時，他還進行研究和寫作，整理自己在各個歷史階段所寫的論文。

1829年，麥迪遜出席了弗吉尼亞憲法會議，擔任聯合主席。該會議的使命是修訂州憲法。這是麥迪遜卸職后公開參加的唯一一次政治活動，足見其對法制建設事業(yè)的高度關注。