在羅斯福競選初期，莫利在咨詢了特格威爾和貝勒之后，草擬下一篇吸取了智囊團思想精髓的備忘錄，并與羅斯福多次討論修改。莫利于5月19日完成備忘錄的撰寫，其主題是羅斯福應(yīng)該向胡佛提出兩套明確的選擇方案，“而不是在名字上有所差異的同一種反動教條”。莫利指出，關(guān)鍵是羅斯福要領(lǐng)導一個具有“自由思想”和“按照計劃行動”的政黨，提倡聯(lián)邦政府應(yīng)該積極抗擊大蕭條，并幫助大蕭條的受害者。備忘錄倡導集中經(jīng)濟規(guī)劃，這是塔格威爾最鐘愛的觀點，羅斯福將其納入第一批農(nóng)業(yè)和工業(yè)政策的制定中。它主張進行銀行體系和有價證券業(yè)改革，包括將投資和商業(yè)銀行分離開來。

此外，備忘錄還極力提倡失業(yè)救濟和興建大型公共工程，但它同時也支持平衡預算，恢復政府信心。這份備忘錄帶著這些互相對立的建議，逐漸制造了一個基本矛盾，即加大開支對抗大蕭條與削減開支平衡預算的矛盾。這也是“百日新政”期間存在的主要問題。莫利在這份備忘錄的序言里首次提到了“新政”這個詞。六星期之后，羅斯福在民主黨全國代表大會上發(fā)表接受提名演說，其中也使用了這個詞語。就此，一個新時代終于被冠以正名。

在接下來的幾個月里，莫利和羅斯福之間逐漸形成了一種親密的關(guān)系。競選期間，也就是在就職前的11個月里，羅斯福游走全國各地發(fā)表競選演說。他的行程有2.7萬英里，足跡遍布全美41個州。對羅斯福來說，出去與選民見面--就像莫利所說--是一件“十足的樂事”。莫利通常都陪伴在羅斯福的左右，他提著裝滿書籍、演說稿和政策備忘錄的箱子，在從一個城市到另一個城市的競選專列上奮筆疾書。

這是一對奇怪的搭檔，隨和、中立、出生顯貴的政治家和嚴肅、注重細節(jié)、永遠銘記自己俄亥俄出生的學者。兩人并不是朋友，因為他們的身份和地位太過懸殊。但他們之間的關(guān)系卻遠非一名野心勃勃的總統(tǒng)候選人與一個才華橫溢、全心全意的下屬之間的關(guān)系。莫利回憶說，是在兩人之間逐漸形成的真正“親密關(guān)系”，才使得“我們在一起時，羅斯福會毫無顧忌地邊想邊說出他的看法”。

競選結(jié)束后，智囊團繼續(xù)工作，為新政府起草政策，領(lǐng)域涉及農(nóng)業(yè)立法、證券市場管制和銀行改革等。莫利仍然是一切行動的中心，“所有意見和建議只有通過莫利當關(guān)的‘一人委員會’才能上達至羅斯福，”《新聞周刊》如此評論道。莫利一直在撰寫羅斯福的就職演說稿。在空位期間，當胡佛邀請羅斯福到白宮商議有關(guān)歐洲戰(zhàn)爭債務(wù)事宜時，莫利的價值得到凸顯。英國和其他債務(wù)國單方面宣布，將延遲償還他們在一戰(zhàn)期間欠美國的債務(wù)。胡佛表示愿意與他們談判，以爭取讓這些國家在其他事務(wù)上作出讓步。

羅斯福關(guān)注的焦點在國內(nèi)，對外債事宜一概不知，因此他不愿意與胡佛就此事作任何深入的討論。于是他叫莫利研究此事。雖然在戰(zhàn)爭債務(wù)方面莫利也不是專家，但他與貝勒一道進行深入廣泛的研究調(diào)查，并準備了相關(guān)問題的索引卡。令莫利感到意外的是，11月22號羅斯福居然叫他一起去白宮與胡佛見面。1月中旬，雙方就戰(zhàn)爭債務(wù)問題舉行第二次會面，羅斯福隨即讓胡佛的顧問就此事直接與莫利對話。