根據(jù)中國(guó)政府的要求，三門(mén)峽大壩工程由蘇聯(lián)的伯克夫主持設(shè)計(jì)，大壩代號(hào)“360”。動(dòng)工之前的1957年4月，中國(guó)政府水利部在北京邀請(qǐng)了70位中國(guó)專家、教授參加了設(shè)計(jì)方案論證會(huì)議。在邀請(qǐng)者中，清華水利系的張光斗與黃萬(wàn)里這兩位30年代自美國(guó)學(xué)成歸國(guó)的水利專家均榜上有名（張光斗，1935年赴美留學(xué)，先后獲美國(guó)伯克利加利福尼亞大學(xué)水利工程學(xué)碩士、哈佛大學(xué)土木工程學(xué)碩士學(xué)位，后中斷博士學(xué)位學(xué)業(yè)于1937年歸國(guó)；黃萬(wàn)里，黃炎培之子，1934年赴美留學(xué)，先后讀過(guò)三所大學(xué)，分別獲碩士與博士學(xué)位。是伊利諾伊大學(xué)的第七個(gè)博士，也是中國(guó)第一個(gè)水利工程學(xué)博士，1937年歸國(guó)）。據(jù)說(shuō)這是一個(gè)“務(wù)虛”的會(huì)議，論證進(jìn)行了7天。當(dāng)時(shí)主持設(shè)計(jì)的蘇聯(lián)專家伯克夫與負(fù)責(zé)這一項(xiàng)目的中國(guó)各級(jí)官員以及絕大多數(shù)專家認(rèn)為，通過(guò)綠化，黃河流域水土保持能很快生效，上游進(jìn)入三門(mén)峽的泥沙能很快減少，因此可用三門(mén)峽的高壩大庫(kù)全部攔蓄泥沙。大壩蓄水后，經(jīng)過(guò)沉淀變清，然后用下泄清水來(lái)刷深黃河下游的河床，從而把黃河一勞永逸地變成地下河——這一思路導(dǎo)致了三門(mén)峽工程規(guī)劃沒(méi)有設(shè)計(jì)泄流排沙的孔洞（后設(shè)計(jì)，但在施工中又被封死）。在當(dāng)時(shí)的政治環(huán)境下，參加論證的70位專家，絕大多數(shù)人對(duì)在三門(mén)峽建壩攔沙于上游，壩下不設(shè)排沙孔洞這一方案，或真心或違心或別有用心地表示擁護(hù)。只有“不知天高地厚”的清華教授黃萬(wàn)里和一個(gè)大學(xué)畢業(yè)不久、名叫溫善章的小技術(shù)員，對(duì)大壩工程提出反對(duì)意見(jiàn)。據(jù)說(shuō)黃萬(wàn)里在七天會(huì)期中，單槍匹馬，舌戰(zhàn)群儒，和蘇聯(lián)專家、中國(guó)專家展開(kāi)激烈論戰(zhàn)。按黃的說(shuō)法：“三門(mén)峽大壩建成后，黃河潼關(guān)以上流域會(huì)被淤積，并不斷向上游發(fā)展，到時(shí)候不但不能發(fā)電，還要淹掉大片土地；同時(shí)，黃萬(wàn)里對(duì)舉國(guó)上下大喊大叫的‘圣人出，黃河清’的說(shuō)法甚為不屑，認(rèn)為‘黃河清’只是一個(gè)虛幻的政治思想，在科學(xué)上是根本不可能實(shí)現(xiàn)的。而贊成這種說(shuō)法的官員、專家，實(shí)出于政治阿諛而缺乏起碼的科學(xué)精神。黃河水流必然挾帶一定泥沙的科學(xué)原理不能違背，即是從水庫(kù)流出的清水，由于沖刷力要比挾帶泥沙的濁水強(qiáng)大，將猛烈沖刷河床，必然使黃河大堤成片崩塌，清水也必將重新變成濁水”云云。

不久，黃萬(wàn)里在校內(nèi)報(bào)紙《新清華》上，以小說(shuō)的形式發(fā)表了《花叢小語(yǔ)》。文章批評(píng)北京新修的道路反漿，公共汽車停駛，要是在美國(guó)，市長(zhǎng)早干不成了，等等。又從“文人多無(wú)骨”引伸到當(dāng)年黃河三門(mén)峽工程的論證。其中一段說(shuō)，“你看章×原來(lái)有他自己一套治理黃河的意見(jiàn)，等到三門(mén)峽計(jì)劃一出來(lái)，他立刻敏捷地放棄己見(jiàn)，大大歌頌一番。并且附和著說(shuō)‘圣人出而黃河清’從此下流河治” 云云。

很快，清華校方把黃氏“大作”《小語(yǔ)》上報(bào)毛澤東，毛看后隨即加上“什么話”按語(yǔ)在6月19日的《人民日?qǐng)?bào)》上刊出。同時(shí)，毛澤東還針對(duì)黃的文章說(shuō)：“有這么一些中國(guó)人，說(shuō)美國(guó)一切都好，月亮也比中國(guó)的圓?！保ㄔ褗^《江河萬(wàn)里》，載《清華園隨筆》，清華大學(xué)出版社2004年出版。以下引文同）黃的文章立即成了反黨、反蘇、反社會(huì)主義的“鐵證”，黃萬(wàn)里被打成“右派”，下放農(nóng)場(chǎng)接受勞動(dòng)改造。后來(lái)黃萬(wàn)里曾對(duì)人說(shuō)：“我的右派帽子是毛主席‘欽定’的，逃也逃不了?！?/p>

當(dāng)1937年黃萬(wàn)里從美國(guó)學(xué)成歸來(lái)時(shí)，途經(jīng)橫濱暫泊，偶遇在日本學(xué)醫(yī)的丁玉雋小姐，二人一見(jiàn)鐘情，同船歸國(guó)后即在廬山舉行了婚禮。丁玉雋的父親乃國(guó)民黨元老丁惟汾，第一次國(guó)共合作時(shí)期，丁任組織部長(zhǎng)，毛澤東任宣傳部長(zhǎng)，二人同為黨國(guó)大員，且頗為友善。而黃炎培則是教育界名宿，國(guó)共合作時(shí)期亦擔(dān)任政府要職，因而黃、丁二位名門(mén)子女的廬山之戀，曾轟動(dòng)一時(shí)，給世人留下了難以忘懷的印象。事隔22年之后的1959年，毛澤東在廬山與彭德懷展開(kāi)政治決戰(zhàn)，他在批彭時(shí)說(shuō)了“你彭德懷和黃萬(wàn)里一樣腦后長(zhǎng)著一塊反骨”等語(yǔ)。