對(duì)達(dá)賴反復(fù)進(jìn)行開導(dǎo)，但達(dá)賴的思想并沒(méi)有真正地轉(zhuǎn)變。所以在1959年3月10日發(fā)生的西藏叛亂中，達(dá)賴還是出逃到印度去了。盡管如此，當(dāng)時(shí)以毛澤東為首的黨中央，還是希望爭(zhēng)取達(dá)賴回國(guó)。1959年4月，在第二屆全國(guó)人民代表大會(huì)第一次會(huì)議期間，毛澤東在接見(jiàn)班禪和阿沛·阿旺晉美等人時(shí)說(shuō)：

本來(lái)我們要根據(jù)和談協(xié)議逐步改變西藏的落后面貌。一九五六年年底我們說(shuō)過(guò)，從一九五七年起六年內(nèi)，西藏可以不進(jìn)行民主改革，連試點(diǎn)也不搞，六年后改不改革，要根據(jù)那時(shí)的情況，由西藏上層和人民群眾共同協(xié)商解決?？墒沁_(dá)賴不高興，叛逃了，這件事是我們所不希望的。但只要他們回心轉(zhuǎn)意，我們還是歡迎的。[2]

正是在這種思想指導(dǎo)下，所以二屆一次全國(guó)人代會(huì)還是決定保留達(dá)賴全國(guó)人民代表大會(huì)常務(wù)委員會(huì)副委員長(zhǎng)和西藏自治區(qū)籌備委員會(huì)主任委員的職位。直到1964年12月下旬，三屆人大一次會(huì)議上，才撤銷他的這些職務(wù)。