從１９９６年到２０００年，孔令輝一直不很順暢。在單打上，孔令輝遇到了前所未有的瓶頸，瓦爾德內(nèi)爾與金澤洙一度成為他的夢魘，薩姆索諾夫、普里莫拉茨也幾次終結(jié)他的冠軍夢想。盡管仍然是世界比賽男單４強(qiáng)里出現(xiàn)頻率最高的選手之一，但是在那５年的時間里孔令輝一直無緣重大比賽單打冠軍，這不能不說是這位世界冠軍心中最大的遺憾。

成就兩個單項桂冠后的孔令輝為了大滿貫等待了５年。２０００年悉尼奧運(yùn)會，孔令輝一路過關(guān)斬將，半決賽中力克瑞典實力派老將、時年３４歲的佩爾森，在決賽中迎戰(zhàn)老對手瓦爾德內(nèi)爾，這是他生命中最重要的一場比賽。

瓦爾德內(nèi)爾是近２０年來橫亙在中國乒乓球選手面前的一座大山。他那神出鬼沒的發(fā)球，爐火純青的前３板功力，細(xì)膩的臺內(nèi)球技術(shù)，隨機(jī)應(yīng)變的技戰(zhàn)術(shù)組合，曾讓許多中國選手產(chǎn)生"恐瓦癥"。兩人對決前，瓦爾德內(nèi)爾曾放出狂言，說自己對孔令輝有心理和經(jīng)驗的優(yōu)勢。此時，悉尼奧運(yùn)會乒乓球比賽已經(jīng)進(jìn)入尾聲，中國隊已經(jīng)順利地包攬了女單、女雙和男雙金銀牌，剩下的這枚男單金牌是最難啃的一塊硬骨頭，也關(guān)系到孔令輝能不能實現(xiàn)"大滿貫"的夢想?？琢钶x只是把一股勁兒憋在肚子里。為了籌備悉尼"大戰(zhàn)"，一貫注重儀容的孔令輝難得一見地剃了平頭。他在比賽之前曾３次理發(fā)，第１次理得不好，第２次理得太怪異，直到第３次才理出了他還比較滿意的、充滿"殺氣"的一頭短發(fā)。

２０００年９月２５日晚１７時１５分，悉尼奧運(yùn)會乒乓球男單決賽。瓦爾德內(nèi)爾時年已經(jīng)３５歲，但他站在孔令輝對面，眼中透出的是沙場老將的自信和殺氣。在３０００多名中國同胞的吶喊聲中，孔令輝徹底拋開一切顧慮，他咄咄逼人的氣勢壓倒了瓦爾德內(nèi)爾。前兩局孔令輝以２∶０領(lǐng)先，但是到了第３局，老瓦亮出了他的高招，用發(fā)球來搶攻，用反限制來控制孔令輝的球路，孔令輝連丟毫無應(yīng)對辦法的兩局。

決勝局開始前，蔡振華提醒孔令輝，"一定要敢于接他的發(fā)球，而且要大膽地接，不要怕失誤，如果只選擇保險的接法，對手的進(jìn)攻將會肆無忌憚，一定要把球送到他最難受的地方"。一語點到要害，孔令輝頻頻用反手切老瓦的發(fā)球，老瓦的反限制戰(zhàn)術(shù)也失靈了，他連續(xù)拉球，但不是出界就是下網(wǎng)?？琢钶x一鼓作氣，把決勝局比分拉大到９∶１。老瓦在１３∶１８落后時試圖作最后掙扎，但兩次拉球失誤使他信心全失。最后，隨著老瓦一記隨意的回球，孔令輝３∶２戰(zhàn)勝這位老對手，成為繼老瓦、劉國梁之后，世界乒壇的第３位大滿貫得主，也成為乒乓球小球時代的終結(jié)者。回憶起那場比賽，孔令輝仍覺得余意未了，"大家都覺得特有殺氣，確實那次比賽我特'火'，好多場都是３∶２贏的。打到?jīng)Q勝局時贏得也很輕松，可能也是這種殺氣震懾了對方吧。"

奪冠一瞬間，孔令輝狂吻胸前的國旗，緊閉雙眼，仰天長嘯、淚流滿面，隨后跳進(jìn)教練懷中慶祝---這一幕已經(jīng)成為中國奧運(yùn)史上的經(jīng)典時刻。確實，當(dāng)胸中積累了５年的悶氣如潮水般奔將出來，孔令輝的反應(yīng)激動甚至有點張揚(yáng)。后來，在說到自己當(dāng)時的表現(xiàn)時，孔令輝說自己看了都覺得"不可思議"。對于性格內(nèi)向的孔令輝而言，當(dāng)時那樣的表現(xiàn)絕對是"絕版"，"我正常情況是不會這樣的，當(dāng)時已經(jīng)瘋狂了。"當(dāng)時，不少媒體不約而同地用了類似的標(biāo)題："ＫＯＮＧ ＩＳ ＫＩＮＧ！"（孔是王?。?/p>

就在２０００年悉尼奧運(yùn)會上，孔令輝與劉國梁合作奪得男雙銀牌。能在奧運(yùn)會這樣重大的賽事上戰(zhàn)勝瓦爾德內(nèi)爾，孔令輝認(rèn)為這是一生非常驕傲的事情。他說自己是看著老瓦打球長大的，無論比賽中的成就，還是打球的天分，老瓦都是一個令人尊敬的運(yùn)動員。

２００１年，隨著國際乒聯(lián)更改規(guī)則，小球改成大球，孔令輝的職業(yè)生涯也逐漸失去了閃亮瞬間，和單打桂冠越來越遠(yuǎn)。２００４年雅典奧運(yùn)會之前的那一段時間是孔令輝運(yùn)動員生涯中最為郁悶的日子。當(dāng)知道自己沒有入選奧運(yùn)單打，雙打第１次公布名單時也沒有自己的名字時，孔令輝有一刻幾乎都不想打球了。好在第１次公布名單并不是最終結(jié)果，在隊里第２輪選拔中，憑借實力，孔令輝如"死里逃生"般拿到奧運(yùn)會雙打的入場券。

２００４年雅典奧運(yùn)會，孔令輝、王皓在１／８男雙比賽中遇到老對手、瑞典老將瓦爾德內(nèi)爾／佩爾森。開局很順利，１１∶８先勝１局，但隨后比賽情緒比較放松的孔令輝、王皓卻６∶１１、９∶１１和９∶１１被對手連扳３局，在第５局比賽中孔令輝、王皓重振旗鼓，但最終被打出氣勢的瑞典老對手攻破１２∶１０擊敗，總比分１∶４慘遭淘汰。男雙賽場的落敗成了"乒乓王子"奧運(yùn)賽場的絕唱。

２００５年５月５日晚，第４８屆世乒賽男雙決賽在上海萬人體育館舉行，當(dāng)孔令輝和王皓以４∶１的壓倒性優(yōu)勢戰(zhàn)勝德國的波爾／許斯，孔王二人和場外指導(dǎo)劉國梁攜手向四面觀眾一一鞠躬致謝，把賽場內(nèi)熱烈的氣氛推向了最高潮。這是從２０００年到２００５年５月，整整５年里，孔令輝在三大賽的單項比賽中拿到的唯一一個冠軍。這也是孔令輝運(yùn)動生涯中的最后一個世界冠軍。

"橫"著來到世界的他開創(chuàng)了中國式的橫拍打法