這年年底，中共南方局書(shū)記周恩來(lái)寫(xiě)信要黃文杰到重慶接受新的工作。由于緊張和勞累，黃文杰染病在身，且非常虛弱。但他還是在聽(tīng)到召喚后，和周惠年歷盡艱險(xiǎn)輾轉(zhuǎn)到渝。

此時(shí)，周惠年已經(jīng)懷有五個(gè)月的身孕，她看黃文杰經(jīng)常奔波于各地，工作如此緊張，整個(gè)時(shí)局又處于動(dòng)蕩不安狀態(tài)，感到生兒育女大不合時(shí)宜。特別是在幾年間她兩度失去丈夫，生育的兩個(gè)孩子都沒(méi)有了父親，便不禁油然生出這個(gè)孩子是否也會(huì)有一天成為孤兒的憂慮。她不愿再面對(duì)這殘酷的可能，就與黃文杰商量，做掉胎中的孩子。

黃文杰與周惠年有過(guò)較長(zhǎng)時(shí)間的接觸，對(duì)妻子的想法十分理解和尊重。于是，周惠年懷著異常復(fù)雜和沉重的心情，做了墮胎的手術(shù)。此后不久，她和許多在重慶工作的干部，根據(jù)組織的安排分別登上幾輛搖搖晃晃的汽車(chē)，向陜北進(jìn)發(fā)。

周惠年終于到了延安。延安天高云淡，不似重慶時(shí)有迷霧和陰霾。這里是中共控制的地區(qū)，不必像在國(guó)民黨統(tǒng)治區(qū)從事地下工作那樣，要把自己的信念、把喜怒哀樂(lè)都埋藏在心底，她感到一種前所未有的輕松愉快。

不久，她被送到設(shè)在大殿溝的中央馬列學(xué)院，成為馬列學(xué)院的第六期學(xué)員。她又一次得到她幼年時(shí)就渴望的讀書(shū)機(jī)會(huì)。自從投身革命后，她就無(wú)暇認(rèn)真地讀書(shū)了。在蘇州反省院倒有時(shí)間，她在那兒讀了《紅樓夢(mèng)》等古典小說(shuō)，此外院方只提供“三民主義”的書(shū)，她未能學(xué)習(xí)更多的知識(shí)。在馬列學(xué)院，她才較多地接觸到革命的理論，這種學(xué)習(xí)生活令她欣喜和滿(mǎn)足。

1940年中秋，本是依中國(guó)傳統(tǒng)家人團(tuán)圓之時(shí)，可周惠年卻蒙受了感情歷程的第三次打擊。原本患有肺病、又飽受監(jiān)獄折磨的黃文杰，由于積勞成疾染上傷寒。一天，日軍飛機(jī)轟炸重慶，他在又潮又陰冷的防空洞內(nèi)躲了很久，受涼發(fā)高燒，經(jīng)搶救無(wú)效，不幸逝世。

消息傳到延安，周惠年又一次陷入深深的悲痛之中，然而，讓她稍感慰藉的是，中國(guó)共產(chǎn)黨充分肯定了黃文杰獻(xiàn)身革命的一生。尚在十八集團(tuán)軍駐重慶辦事處的周恩來(lái)、董必武、鄧穎超等親為黃文杰送葬；《新華日?qǐng)?bào)》、《群眾》均出專(zhuān)版紀(jì)念“對(duì)黨無(wú)限忠誠(chéng)，對(duì)人對(duì)事大公無(wú)私”的黃文杰。葉劍英在其悼念文章中，稱(chēng)贊黃文杰“做事負(fù)責(zé)認(rèn)真，有駱駝般精神”。

從延安馬列學(xué)院學(xué)習(xí)結(jié)業(yè)后，周惠年就在中共中央機(jī)關(guān)工作，周恩來(lái)回到延安后，曾經(jīng)兩度在重要場(chǎng)合表?yè)P(yáng)過(guò)周惠年，高度評(píng)價(jià)她當(dāng)年在白區(qū)的地下工作和她為革命做出的默默奉獻(xiàn)。

新中國(guó)成立后，周惠年在中共中央書(shū)記處政治秘書(shū)室任行政秘書(shū)，后調(diào)到中共中央馬恩列斯著作編譯局工作。