王崇古升任三邊總督后，對這件事情進行了深入的調查，并提出了一些應對方案。他發(fā)給士兵銀錢，讓他們收買一些邊民，為自己充當探子，并不斷改善邊境地區(qū)的政策，減輕了課稅，以此來吸引更多的“板升”重新返回內地。另一方面，加大“貿易制裁”，不允許私自向河套地區(qū)販運日常用品，使得這些“板升”不得不回到內地在大同等地采購生活必需品。隨著來往的漸漸加強，一些叛逃的漢人發(fā)現內地的政策有所改變，生活在這邊更好一點，于是又紛紛再叛俺答，回到明朝境內，王崇古的策反政策初見成效。但對于逐漸壯大的俺答勢力，依然無法下手，不敢冒進，從來沒有主動出擊過，這也是對朝廷以守為主的戰(zhàn)略政策的執(zhí)行。

但誰也沒想到，他們祖孫二人會因為一個女子反目成仇。如何處理把漢那吉的歸附這一事件，直接關系到明朝與當時蒙古族中最強大的韃靼部的關系。而此時俺答汗已調兵“分道入犯，索把漢（把漢那吉）甚急”。邊關戰(zhàn)火一觸即發(fā)。王崇古與方逢時聯名上書，他們認為，應接受把漢歸附，“宜給之宅舍，授之職銜，易其服用，以悅其心”。

但在王崇古的上書到達皇帝的同時，張居正的一個指示意見也到了王崇古的手中。這讓他很是奇怪，這件事情他還沒有稟報朝廷，遠在北京的張居正怎么就已經提出了解決方案呢？這就與張居正的盡職盡責有關，他雖然身在北京，但時刻關注著邊疆的動態(tài)。一有什么新動向，他馬上就能知悉。

張居正的意見也是讓他們趕緊善待把漢那吉，他可是奇貨可居啊。先扣著他，看看新動向。如果俺答執(zhí)意要贖回把漢那吉，那我們就要求他拿趙全、邱富等人進行交換。如果俺答置之不理，那我們就給他這個孫子冊封一個新號，讓他們祖孫二人在內斗中互相消耗。

這些設想的提出，說明張居正處事的精細和謹慎。他提醒王崇古對于各種可能性都要有所準備，以防患于未然。待情況稍有明朗，俺答決定以趙全換回把漢那吉，張居正又及時做出判斷，認為這是難得的機遇，一個周密的謀劃已經成竹在胸。但一些大臣因為13年前的桃松寨事件，怕上當受騙，不再相信俺答交換人質的諾言。桃松寨事件發(fā)生在嘉靖三十六年（1557年），俺答之子辛愛的小妾桃松寨因與人通奸事發(fā)，為逃避懲罰，投降了明朝。辛愛得知后，佯裝以趙全、邱富交換，騙取總督楊順放回桃松寨，桃松寨隨即被辛愛所殺，漢奸也未交還明朝。把漢那吉的來降很容易使人聯想到桃松寨事件，因擔心再次上當受騙，官員們反對接納把漢那吉。在俺答派出大兵壓陣，強行索要把漢那吉之際，朝臣們更是驚恐不安。張居正當機立斷，力排眾議，認為這不同于桃松寨事件，不僅不必為之擔心，反而是可以利用的大好時機。在給王崇古的信中，他做了詳細、具體的布置。他認為，俺答兵臨城下，索要其孫，這是對我方有利的事，我方可一面扼險守要，嚴陣以待；一面據理相告要求結盟，并讓俺答殺掉趙全。張居正在給王崇古的信中按捺不住自己的興奮，他說：“向者仆固謂：世必有非常之人，然后有非常之事；有非常之事，然后有非常之功。此所謂非常之事，非公孰能了之？”

在這封信中，張居正還提醒王崇古說，把漢那吉的出逃，是其謀士出的主意，此人很有智謀?？膳扇税档嘏c他聯絡，告訴他明軍知道一切都是他的謀劃，會記住他的功勞，請他促成結盟之事。如果有可能除掉俺答，我們即封把漢那吉為王，遣兵送歸故地，從此可長享富貴。

與此同時，張居正又讓王崇古借助自己手下收買的探子，給俺答送信，聲明希望議和的態(tài)度。信中明白指出俺答的肘腋之患正是他的兒孫之亂，并以明朝的軍事實力儆誡，又利用俺答祖孫的矛盾，策動把漢那吉的謀士倒戈。陽謀、陰謀雙管齊下，這一切又以深明大義的姿態(tài)，娓娓道來，在委婉中洋溢著義正詞嚴的氣度。果然不出張居正所料，這一席有關俺答切身利害的陳述，終于打動俺答。王崇古又讓把漢那吉穿上漢人最尊貴的紅袍玉帶，與俺答相見，以示明朝的誠意。俺答本以為把漢那吉已被誅殺，卻得到這意外的驚喜，從而打開了和解的大門。趙全眼見蒙漢和解的大勢已不可阻擋，不得不為自己留了一條后路，投書方逢時表示悔過，愿回歸中土。這又豈能為明軍所容？于是，方逢時將計就計，隨即把這封信轉交給俺答。俺答見這漢奸反復無常，又要背叛自己，大為震怒，立即把趙全捆縛，送歸明朝。

這就使得一個很緊張的邊疆危機，最終化干戈為玉帛，以議和收場。但張居正認為，議和還不能從根本上解決問題。因為隨著時間的推移，就像明朝已經改變了最初的軍事戰(zhàn)略一樣，蒙古各部也囿于眼前利益迫于生計，已經不再懷有重新入主中原的野心，這時的戰(zhàn)亂搶掠主要是以爭奪日用物資為主。而解決這個問題只有靠經濟手段才能完成。因此，張居正決定趁熱打鐵，準備提出封貢通市。