一九○六年十一月六日，清廷發(fā)布中央各衙門官制上諭。

上諭基本上采納了之前端方在官制改革的奏折中提出的方案。

軍機(jī)處仍為“行政總匯”，各部尚書(shū)作為參與政務(wù)大臣“輪班值日，聽(tīng)候招對(duì)”；外務(wù)部、吏部不變；巡警部改為民政部；戶部改為度支部；太常、光祿、鴻臚三寺并入禮部；練兵處和太仆寺并入兵部，兵部改為陸軍部，增設(shè)海軍部和軍咨府，未設(shè)之前統(tǒng)歸陸軍部辦理；刑部改為專任司法的法部，大理寺改為專掌審判的大理院；工部與商部合并為農(nóng)工商部；增設(shè)專管輪船、鐵路、電信、郵政事務(wù)的郵傳部。各部官員“均設(shè)尚書(shū)一員、侍郎二員，不分滿漢”。其余內(nèi)閣、宗人府、翰林院、內(nèi)務(wù)府、順天府等均“毋庸更改”。上諭最后特別要求：“所有新簡(jiǎn)及原派各大臣責(zé)無(wú)旁貸，惟當(dāng)顧名思義，協(xié)力同心，盡去偏私，真任勞怨，務(wù)使志無(wú)不通，政無(wú)不舉，庶幾他日頒行憲法，成效可期。”

上諭發(fā)布的第二天，新任各部大臣的名單公布了：

外務(wù)部尚書(shū)瞿鴻禨（原任）

吏部尚書(shū)鹿傳霖（原任）

民政部尚書(shū)徐世昌（原任巡警部尚書(shū)）

度支部尚書(shū)溥颋（宗室）

禮部尚書(shū)溥良（宗室）

學(xué)部尚書(shū)榮慶（蒙族）

陸軍部尚書(shū)鐵良（滿族）

法部尚書(shū)戴鴻慈

農(nóng)工商部尚書(shū)載振（皇族）

郵傳部尚書(shū)張百熙

理藩部尚書(shū)壽耆（宗室）

大理院正卿沈家本

按照清朝舊制，政府各部均設(shè)滿漢尚書(shū)兩人。現(xiàn)在號(hào)稱滿漢不分，結(jié)果十二個(gè)政府部別中，漢官六人，滿蒙貴族六人。但是，外務(wù)部尚書(shū)瞿鴻禨雖是漢人，但上面有總理大臣奕劻和會(huì)辦大臣那桐，瞿鴻禨不能算是該部的實(shí)權(quán)主管。于是，滿漢比例實(shí)際上是六比五。且軍務(wù)、財(cái)政等最為重要的部門，權(quán)力都掌握在滿人手中。特別是陸軍部由鐵良把持，這就意味著連同袁世凱的北洋新軍在內(nèi)，鐵良將統(tǒng)轄全國(guó)的新軍。

有評(píng)論說(shuō)，所謂中央集權(quán)，實(shí)際上就是軍權(quán)和財(cái)權(quán)集中在滿人手中。

這份名單不但導(dǎo)致了統(tǒng)治集團(tuán)內(nèi)部的滿漢紛爭(zhēng)立即顯現(xiàn)，而且讓國(guó)內(nèi)以民族資本家張謇為代表的立憲派們大為失望。他們認(rèn)為，官制改革并沒(méi)有實(shí)質(zhì)性的內(nèi)容，反而暴露了朝廷預(yù)備立憲的虛偽。

實(shí)際上，官制改革中的矛盾是滿漢交錯(cuò)的。

滿族大臣奕劻始終支持袁世凱，而向慈禧太后打小報(bào)告的卻是漢大臣瞿鴻禨。毫無(wú)疑問(wèn)的是，除奕劻之外，滿族大吏們之所以對(duì)袁世凱心懷戒備，并不僅僅因?yàn)樗且粋€(gè)漢大臣，而是他手中日益擴(kuò)大的軍權(quán)。

官制改革會(huì)議結(jié)束后不久，朝廷突然宣布在河南彰德舉行南北大會(huì)操。所謂“大會(huì)操”，就是“大比武”的意思。北軍指定的是袁世凱的北洋新軍第三鎮(zhèn)，南軍指定的是張之洞的湖北新軍第八鎮(zhèn)。選擇這兩支部隊(duì)比武，是瞿鴻禨的主意。而更讓袁世凱感到不妙的是，具有裁判權(quán)的閱兵大臣，是對(duì)他疑忌最大的滿族大臣鐵良和良弼。果然，比武的結(jié)果是袁世凱輸給了張之洞。緊接著，就有御史參奏袁世凱，說(shuō)他擁兵自重。袁世凱知道，慈禧太后并不知道內(nèi)幕，這全是皇親國(guó)戚們搞的鬼。自己積極呼吁官制改革，改革的內(nèi)容之一就是減少官員的兼職，現(xiàn)在皇親國(guó)戚們顯然是有意讓他交出軍權(quán)。與皇親國(guó)戚抗拒？沒(méi)那個(gè)力量，也不到那個(gè)時(shí)候。把苦心經(jīng)營(yíng)多年的軍權(quán)交出去？心血白費(fèi)不說(shuō)，于心何甘？思來(lái)想去，袁世凱決定把北洋新軍第一、第三、第五、第六共四個(gè)鎮(zhèn)交給鐵良掌控的陸軍部直接管轄，然后借口現(xiàn)在外國(guó)軍隊(duì)還沒(méi)有從京城周邊撤離完畢，奏請(qǐng)駐防山海關(guān)的第二鎮(zhèn)和駐防天津的第四鎮(zhèn)仍歸自己指揮，以有效保衛(wèi)京畿的安全。袁世凱的奏折剛呈遞上去，朝廷立即委派滿族將軍鳳山接管了北洋四鎮(zhèn)的指揮權(quán)。

這是袁世凱升任直隸總督以來(lái)遭受的第一次嚴(yán)重挫折。

他從身兼十一職，即直隸總督兼北洋大臣、兼管長(zhǎng)蘆鹽政、督辦關(guān)內(nèi)外鐵路、參預(yù)政務(wù)大臣、督辦商務(wù)大臣并會(huì)議各國(guó)商約、督辦蘆漢鐵路公司事宜、督練八旗兵丁、督修正陽(yáng)門工程、督辦電政大臣、會(huì)訂商律大臣、會(huì)辦練兵大臣，一下子只剩下直隸總督和北洋大臣兩個(gè)官職了。其實(shí)，即使袁世凱才略非比尋常，也很難想象他能一人勝任十一種責(zé)任莫大之職。

在官制改革中，中了瞿鴻禨暗算的奕劻，以及被滿族貴族合力排擠的袁世凱，成了最大的輸家。

接著，地方官制改革開(kāi)始了。