到了明末，錢謙益根據(jù)內(nèi)閣所藏詔書，并參考招辭，也認(rèn)為這是一樁冤案，李善長是胡惟庸案的一個殉葬品，“善長之罪，實(shí)由婚姻誼重，家門慮深，目瞪口吱，受惟庸之籠絡(luò)而不能自拔，卒委身以殉之?！?/p>

胡惟庸、李善長之死，實(shí)是在為新制度犧牲。

陸續(xù)有一些開國元勛與胡黨勾結(jié)“共謀不軌”的案件被揭發(fā)，一個叫周敬心的官員上疏批評政府，“大戮官民，不分臧否”，最后皇帝本人也承認(rèn)，在胡惟庸黨案及歷年的政治清洗中總共處死了約三萬余人。

1393年涼國公藍(lán)玉被殺，張開了誅殺功臣的羅網(wǎng)。藍(lán)玉是開平王常遇春的妻弟，“長身赪面，饒勇略，有大將才”，以軍功升大將軍，封涼國公，愈加的驕蹇自恣，縱容手下莊奴強(qiáng)占東昌民田，御史前來查問，被他趕跑。北征回來時，經(jīng)過喜峰關(guān)，因?yàn)樘旌诓槐嫒擞埃仃P(guān)的士兵不敢開門，他竟縱兵毀關(guān)強(qiáng)闖。有人告發(fā)他還強(qiáng)占了元君的一個妃子，那妃子受辱后自殺了?；实蹏?yán)厲批評了藍(lán)玉，藍(lán)玉還是不知收斂，西征得勝回到京師，受封為太子太傅，他不滿意居于宋國公馮勝和潁國公傅友德之下，趁著酒性嚷嚷，難道憑我的功勞還當(dāng)不上一個太師嗎？

藍(lán)玉的恃功驕縱刺激了朱元璋，他指使一個錦衣衛(wèi)指揮誣告藍(lán)玉謀反，控告他與景川侯曹震等人企圖趁皇帝出宮舉行躬耕“藉田”儀式時發(fā)動兵變。曹震、戶部侍郎傅友文等一批高官相繼被逮，一番虛張聲勢的審訊后，連坐處死一萬五千余人，列侯以下坐黨夷滅者不可勝數(shù)，幾乎把打天下的將領(lǐng)給一鍋端了。因藍(lán)案公布的《逆臣錄》，就包括一公、十三侯、二伯。之后，宋國公馮勝、潁國公傅友德等亦相繼被賜死。至這年秋天，皇帝下詔：“藍(lán)賊為亂，謀泄，族誅者萬五千人。自今胡黨藍(lán)黨，概赦不問。”看似皇恩浩蕩，實(shí)際上功臣宿將已殺得差不多了。

曾在李善長一案中出過大力的吏部尚書詹徽，被列為藍(lán)黨同謀一同處死?！睹魍ㄨb》稱，詹徽本不在藍(lán)黨之列，會審藍(lán)玉一案時，他喝令藍(lán)玉速速老實(shí)交待，毋得株連他人，藍(lán)玉大叫，詹徽也是一起謀事的，于是為人一向陰險(xiǎn)刻薄的詹徽也被戲劇性地拿下了?！睹魍ㄨb》還援引當(dāng)時的私家記述稱，藍(lán)玉被誅，與燕王朱棣有關(guān)。洪武二十年，藍(lán)玉以征虜左副將軍隨同馮勝征納哈出，出征歸來，已拜為大將軍的他向皇太子朱標(biāo)秘密進(jìn)言，說燕王朱棣有政治野心，還說有望氣者言，燕王的封地北平有天子氣，須得小心提防。朱標(biāo)是個忠厚人，竟把這話開玩笑地說與了皇弟朱棣。1392年春天，太子朱標(biāo)病亡，燕王來京師參加吊唁，在與皇帝的交談中，數(shù)次流露出對元勛公侯縱恣不法尾大不掉的憂慮，他的擔(dān)憂觸動了皇帝本就敏感的神經(jīng)，于是沒過幾個月，藍(lán)玉就大禍臨頭。