1942年2月，日本宣布香港為日軍占領區(qū)，任命陸軍中將磯谷廉介為香港總督，總督府設在中區(qū)匯豐銀行。在三年零八個月的殘暴統(tǒng)治期間，日本占領當局采取了以掠奪香港資源為核心的經(jīng)濟政策，以支持所謂的”大東亞圣戰(zhàn)“。它通過兩家日本銀行——正金銀行和臺灣銀行，接管了香港主要的外資銀行，還大量發(fā)行軍票進行大肆掠奪。對所謂敵國企業(yè)實行查封，怡和、太古等英資大公司在香港和中國內(nèi)地的絕大部分業(yè)務均告停頓，九龍倉在尖沙嘴的碼頭貨倉遭到嚴重損毀。在對外貿(mào)易方面，占領當局實行貿(mào)易壟斷政策，通過日本商人組成的香港貿(mào)易聯(lián)合會，控制了香港的海外貿(mào)易。3月，日本當局公布香港占領地管理法，嚴格限制當?shù)厝嗣襁w移和從事經(jīng)濟活動。根據(jù)該法令，任何人出入境、在港居住或經(jīng)營生意，都必須得到總督的批準。香港大部分公司、商行的生意陷于癱瘓，利豐也不例外。馮柏燎因為拒絕與日本人合作，生意無法再維持下去，域多利電筒廠被迫宣告結業(yè)，該廠全部機器設備均被占領軍征用。

馮柏燎一家唯有變賣珠寶、產(chǎn)業(yè)維持生計。他原計劃要攜全家離開香港重返內(nèi)地，但因占領當局的限制法令未獲準離去，只好與家人，包括高齡的母親、馮慕英、馮漢柱、李馮麗華等，繼續(xù)留在香港九龍?zhí)恋募抑?，等待時機。不過，馮柏燎把五子馮漢興送到廣東韶關繼續(xù)學業(yè)；其他幾個年幼的子女，包括馮漢邦、馮麗嫦、馮漢彥、馮麗靄等，送返內(nèi)地經(jīng)重慶前往美國或英國。這幾個子女后來在美國或英國都完成了大學學業(yè)，取得了高級學位，成為學有素養(yǎng)的專業(yè)人士。其中，馮漢邦從美國一所大學畢業(yè)，成為土木工程教授，馮漢彥則成為一名醫(yī)生。

1943年，廣州日軍占領當局宣布，華僑必須返穗繳納物業(yè)稅，馮柏燎遂乘機向香港日本軍政府申請回廣州重新登記他的房地產(chǎn)以及繳交物業(yè)稅，獲得了批準。馮柏燎回到闊別多年的廣州，巡視在六二三路的利豐物業(yè)，然而他看到的卻是頹垣斷壁、一片廢墟，眼看一生事業(yè)毀于此，難免觸景傷情。這時，馮柏燎已步入老年，患有高血壓，旅途勞累加上情緒激動，突然得了中風癥，不幸于4月15日病亡。其后，馮柏燎家人攜同他年老的母親，借口奔喪舉家離港返穗。當時，將馮柏燎年老的母親送往廣州，實在是一件相當困難的事情。利豐的藤器工人特地為她制造了一輛藤制人力車，將她從九龍?zhí)良抑兴偷较愀鄞a頭。大約一個月后，老人家也因為天氣環(huán)境轉(zhuǎn)變以及水土不服而與世長辭。其余的家人遂留在廣州，直到抗戰(zhàn)結束。

馮柏燎先生是香港乃至中國早期行商的佼佼者，他在青少年時即接受西方先進文化的教育，精通英語，由于經(jīng)常到歐美考察，是香港商人中最早與國際接軌、具有國際視野的先驅(qū)，了解世界市場動態(tài)。他抱著滿腔熱情試圖以商業(yè)救國，可惜生不逢時，遇到的是國內(nèi)連年戰(zhàn)亂、外國侵略。他一生最重要的貢獻，是創(chuàng)辦了利豐，為利豐奠定百年基業(yè)。

1937年出版的《香港華人名人史略》，對馮柏燎先生有極高的評價：