接到李大釗寄來(lái)的《青春》，陳獨(dú)秀一氣讀完，深深為李大釗的浩然正氣所觸動(dòng)，陳獨(dú)秀忽又想起章士釗對(duì)李大釗的評(píng)價(jià)：“才不如識(shí)，識(shí)不如德”。他嘴角不禁浮起一絲笑意，自言自語(yǔ)道：“守常（編者按：指李大釗，下同）其文如其人??！”

正如陳獨(dú)秀所料，《青年雜志》影響迅速擴(kuò)大開(kāi)來(lái)，但是樹(shù)大招風(fēng)，康有為于9月20日發(fā)表致總統(tǒng)總理書(shū)，主張“以孔子為大教，納入憲法”。這顯然與《新青年》所主張的革新思想是格格不入的。

陳獨(dú)秀針?shù)h相對(duì)，在10月1日出版的《新青年》第2卷2號(hào)上，他提出學(xué)習(xí)西洋文明的主張，認(rèn)為“不必遠(yuǎn)道乞靈于孔教”，掀起了打倒孔家店的文學(xué)革命風(fēng)潮。此后，《新青年》的影響繼續(xù)擴(kuò)大，在國(guó)內(nèi)有發(fā)行處74處，國(guó)外已發(fā)行到新加坡。

1917年1月4日，蔡元培任北京大學(xué)校長(zhǎng)。隨即，他向教育部請(qǐng)示派陳獨(dú)秀為北京大學(xué)文科學(xué)長(zhǎng)。陳獨(dú)秀就任文科學(xué)長(zhǎng)，在北京大學(xué)校園里一時(shí)議論紛紛，贊同與貶斥沸沸揚(yáng)揚(yáng)，引發(fā)了一陣風(fēng)波。風(fēng)波平息下去后，陳獨(dú)秀住到北池子箭桿胡同9號(hào)（今20號(hào)），《新青年》編輯部同時(shí)搬到了北京。

1917年1月底，陳獨(dú)秀為繼續(xù)倡導(dǎo)文學(xué)革命，響應(yīng)胡適《文學(xué)改良芻議》一文，寫(xiě)了《文學(xué)革命論》：“余甘冒全國(guó)學(xué)究之?dāng)?，高張‘文學(xué)革命軍’大旗，以為吾友之聲援。旗上大書(shū)特書(shū)吾革命軍三大主義，曰，推翻雕琢的阿諛的貴族文學(xué)，建設(shè)平易的抒情的國(guó)民文學(xué)；曰，推倒陳腐的鋪張的古典文學(xué)，建設(shè)新鮮的立誠(chéng)的寫(xiě)實(shí)文學(xué)；曰，推倒迂晦的艱澀的山林文學(xué)，建設(shè)明暸的通俗的社會(huì)文學(xué)。”結(jié)尾，他豪氣干云地宣稱(chēng)：“予愿拖四十二生的大炮，為之前驅(qū)！”

陳獨(dú)秀始終高舉“民主”和“科學(xué)”兩面旗幟，活躍在批判封建主義的最前線(xiàn)?！缎虑嗄辍分苯影l(fā)起了新文化運(yùn)動(dòng)，并推動(dòng)它在全國(guó)的發(fā)展，為馬克思主義在上海乃至全國(guó)的傳播準(zhǔn)備了條件。1919年6月，陳獨(dú)秀因?yàn)樯l(fā)《北京市民宣言》遭到反動(dòng)政府逮捕，在監(jiān)獄中關(guān)押了98天才被釋放。這期間陳獨(dú)秀受李大釗的影響，思想慢慢發(fā)生轉(zhuǎn)變，逐漸向馬克思主義者轉(zhuǎn)變。