朱紈之死有其更深刻的原因。朱紈的提拔者是夏言。夏言遭嚴(yán)嵩陷害被殺后，作為夏言的親信之一，朱紈被殺早在預(yù)料之中。朱紈之死，完全是“禁海派”與“弛禁派”斗爭(zhēng)的結(jié)果。

在當(dāng)時(shí)，對(duì)于海禁問(wèn)題有以下一些觀點(diǎn)。

1）閉關(guān)絕貢。張罛、歸有光認(rèn)為，不能為了區(qū)區(qū)微利，而造成百姓生靈涂炭。如今?？苤試?yán)重，全是互市的原因。當(dāng)年鄭和下西洋就有違祖制，引得那些亡命之徒勾引外夷，釀成百年之禍。

2）朝貢貿(mào)易的同時(shí)，進(jìn)行積極的海禁。持此觀點(diǎn)的主要代表是錢薇和朱紈、唐順之，他們的主張是蕩平走私窩點(diǎn)后，重新建立市舶，派遣高官監(jiān)督，完全推行舊制。

3）海禁御倭。胡宗憲和屠仲律認(rèn)為：倭寇數(shù)萬(wàn)人之所以能夠長(zhǎng)驅(qū)直入，完全在于國(guó)人之中的漢奸接濟(jì)并為之向?qū)?。這和北疆?dāng)橙丝梢砸u擾邊關(guān)，其有漢奸相助是一個(gè)道理。因此，必須要嚴(yán)行稽查。

對(duì)船不能實(shí)行國(guó)初“寸板不得入?！钡恼?，這樣會(huì)使沿海邊民生計(jì)全無(wú)。所以，雙桅尖底船要改為平底單桅，并對(duì)之做好記號(hào)，時(shí)常查驗(yàn)。

對(duì)貨物，嚴(yán)查之。捕魚(yú)船上的物品除了捕魚(yú)之具和水米之外，如果有其他東西則予以沒(méi)收。每處關(guān)卡都要有責(zé)任人，出了問(wèn)題可以追究到個(gè)人。

4）寬海禁，開(kāi)放民間海外貿(mào)易。持此觀點(diǎn)的最有名的就是福建巡撫譚綸，其他人則有郭造卿、王言、王世懋、唐樞、鄭曉等。

他們認(rèn)為：細(xì)民以海為業(yè)，正如嬰兒靠母乳為生一樣。老百姓越窮越容易為盜，因此，禁也無(wú)用。每到捕黃魚(yú)的時(shí)候，聚船數(shù)千都是犯法的，但誰(shuí)又忍心禁止他們?nèi)ゲ遏~(yú)呢？與其這樣，還不如松海禁。這樣不但可以收取稅務(wù)增加軍餉開(kāi)支，而且保證了百姓生計(jì)。

朱紈被殺后，通倭的海盜利益代言人獲得空前勝利。海盜勢(shì)力再次大起，明廷沒(méi)有辦法，最終派遣胡宗憲再次剿倭。盧鏜、俞大猷開(kāi)始整頓海防，然而，因?yàn)橹旒w事件的影響，盧鏜作為當(dāng)事人也有些縮手縮腳。1553年閏三月，王直率領(lǐng)倭寇，領(lǐng)百余艘戰(zhàn)船，在臺(tái)灣到淮北的廣大海域內(nèi)進(jìn)行搶掠，就連南京都受到威脅。

嘉靖皇帝在悔恨中，命南京兵部尚書張經(jīng)，以都察院右副都御史總督南直隸、浙江、山東、兩廣、福建等處軍務(wù)的身份處理倭寇事宜。但沒(méi)有多久，張經(jīng)在獲得“王江經(jīng)大捷”后，反被嚴(yán)嵩迫害處死。

其后，嚴(yán)嵩文靠胡宗憲，武靠戚繼光、俞大猷，先后誘殺了王直、徐海等。直到嘉靖四十五年（1566年）倭寇之患才漸漸平息。隨著倭寇侵?jǐn)_高潮的退去，行將就木的嘉靖皇帝也似乎明白了問(wèn)題所在，因此“海禁松弛”的時(shí)代再次來(lái)臨。