第三階段是投資體制改革階段。改革開放以來，國家對原有的投資體制進行了一系列改革，打破了傳統(tǒng)計劃經(jīng)濟體制下高度集中的投資管理模式，初步形成了投資主體多元化、資金來源多渠道、投資方式多樣化、項目建設(shè)市場化的新格局。但是，現(xiàn)行的投資體制還存在不少問題，特別是企業(yè)的投資決策權(quán)沒有完全落實，市場配置資源的基礎(chǔ)性作用尚未得到充分發(fā)揮，政府投資決策的科學(xué)化、民主化水平需要進一步提高，投資宏觀調(diào)控和監(jiān)管的有效性需要增強。最近幾年隨著改革的不斷深化，為了使投資、建設(shè)、管理、使用等職能合理分離，使管理更專業(yè)化、規(guī)范化，國務(wù)院決定進一步深化投資體制改革，于2004年發(fā)布了國發(fā)［2004］20號文，即《國務(wù)院關(guān)于投資體制改革的決定》。“代建制”就是我國各省、市、地區(qū)經(jīng)過探索而發(fā)展出的針對政府投資項目的新型管理方式，目前正在試行中。

這種代建模式按管理機構(gòu)的性質(zhì)可分為政府機關(guān)型、事業(yè)單位型、企業(yè)型多種形式。

（1）政府機關(guān)型。即由政府主管部門直接負責(zé)工程項目建設(shè)管理。在政府投資項目要統(tǒng)一采購、統(tǒng)一核算、統(tǒng)一建設(shè)的改革思想指導(dǎo)下，成立“統(tǒng)建辦”?！敖y(tǒng)建辦”擔(dān)任政府投資的非經(jīng)營性重點工程的業(yè)主，負責(zé)政府投資項目的統(tǒng)一建設(shè)與管理，將原屬于各政府機構(gòu)的建設(shè)項目統(tǒng)一進行管理、建設(shè)，并撤銷設(shè)在原政府分屬機構(gòu)的基建處。統(tǒng)建辦不經(jīng)手資金，而是在工程圖樣經(jīng)審查、投資總量經(jīng)批準后，由施工單位報工作量，監(jiān)理單位現(xiàn)場代表審查簽字，報主管財政部門，財政部門直接撥給施工單位。工程的質(zhì)量評定由各級質(zhì)量監(jiān)督站進行，質(zhì)監(jiān)站進行全過程質(zhì)量監(jiān)督。工程完工后，統(tǒng)建辦向使用方交鑰匙。

（2）事業(yè)單位型。即政府設(shè)立專門的事業(yè)單位，從事建設(shè)項目的管理——在建設(shè)主管部門下設(shè)專門的項目建設(shè)管理公司，這類公司為非營利性機構(gòu)，專門負責(zé)對政府投資的部分市政基礎(chǔ)設(shè)施項目的實施管理。

（3）企業(yè)型。即在項目計劃確定以后，由有關(guān)政府部門委托或招標選擇的一家企業(yè)（項目管理咨詢機構(gòu)）代行業(yè)主職能。