當(dāng)袁世凱回老家的時(shí)候，北洋大臣交給了直隸藩司吳重熹護(hù)理。袁世凱回到天津后，就上書(shū)請(qǐng)求接回印綬，接到的圣旨是：

袁世凱著派充督辦商務(wù)大臣，與張之洞會(huì)同辦理，并會(huì)議各國(guó)商約事宜。欽此。

十一月初九，又接到圣旨：

現(xiàn)在八旗挑選兵丁已逾萬(wàn)人，著派魁斌、溥倫、桂春、景灃、榮慶、鐵良于所挑人數(shù)內(nèi)，再行挑選四千人，并著姜桂題隨同遴選。所挑之人數(shù)，先派三千人交袁世凱認(rèn)真訓(xùn)練，期成勁旅；其未經(jīng)挑入之兵丁，如有尚堪充選者，著一并記名。俟著有成效，再行輪次分派前往，俾資練習(xí)。欽此。

袁世凱接到訓(xùn)練八旗兵丁的圣旨后，就入京陛見(jiàn)，袁世凱在回答皇帝提出的問(wèn)題時(shí)說(shuō)，沒(méi)有軍隊(duì)就無(wú)法立國(guó)，全國(guó)除湖北省之外，各省的軍制都還是以前的舊制，只是在浪費(fèi)國(guó)家的錢(qián)財(cái)，必須各省通力協(xié)作才行。這時(shí)西太后把袁世凱看做股肱心腹，所以對(duì)他言聽(tīng)計(jì)從。于是下詔：

練兵之道，最忌紛歧，曾經(jīng)迭次降旨，飭各省督撫整頓兵制，期歸一律。乃近來(lái)各省奏報(bào)，仍多搪塞，絕少切實(shí)辦法，殊難望有成效。查北洋、湖北訓(xùn)練新軍，頗具規(guī)模，自應(yīng)逐漸推廣。所有河南、山東、山西各省，著速即選派將弁頭目，赴北洋學(xué)習(xí)操練。江蘇、安徽、江西、湖南各省，選派將弁頭目，赴湖北學(xué)習(xí)操練，成后即發(fā)回各原省，令其管帶新兵，認(rèn)真訓(xùn)練，以資得力而期畫(huà)一。每年由湖北、北洋請(qǐng)旨簡(jiǎn)派大員，分往校閱，按其優(yōu)劣，嚴(yán)加甄別，用副朝廷整飭武備，實(shí)事求是之至意。其詳細(xì)章程，著袁世凱、張之洞妥議會(huì)奏，請(qǐng)旨遵行。欽此。

十一月二十七日又下旨：

正陽(yáng)門(mén)工程，著派袁世凱、陳璧核實(shí)查估修理。欽此。

十二月十七日又下旨說(shuō)：

前因電務(wù)為軍國(guó)要政，應(yīng)歸官辦，已諭令袁世凱、張之洞籌還商股，將各電局悉數(shù)收回，候派大員經(jīng)理。著即派袁世凱為督辦大臣，直隸布政使吳重熹，著開(kāi)缺以侍郎候補(bǔ)，派為駐滬會(huì)辦大臣。該局改為官辦之后，其原有商股不愿領(lǐng)回者，仍準(zhǔn)照舊合股，朝廷于維持政體之中，仍寓體恤商情之意。該大臣等務(wù)當(dāng)通籌全局，認(rèn)真辦理。將從前積弊，一律剔除，以期上下交益。欽此。

清光緒二十九年（ 1903 ）正月，朝廷下旨云：

三載考績(jī)，為國(guó)家激揚(yáng)大典，京內(nèi)外滿(mǎn)漢諸臣，有能恪供職守，勞績(jī)最著者，允宜特加甄敘，以示優(yōu)異。茲當(dāng)京察屆期，吏部開(kāi)單奏請(qǐng)，朕詳加披閱……直隸總督袁世凱……盡心規(guī)畫(huà)，勞怨不辭，均著交部議敘。欽此。