最終，這些移民都被安置在了隴東平原上：回民主要安置在平?jīng)?、?huì)寧、靜寧、安定、秦安等地，漢民主要安置在了安定等地。左宗棠的這些政策使得當(dāng)時(shí)的一些陜甘漢人上層非常不滿，他們認(rèn)為左宗棠袒護(hù)回民不照顧漢民。許多當(dāng)?shù)毓倮舳及抵凶钃线@些政策。為了執(zhí)行自己的政策，左宗棠貶廢了多名地方文武官員、殺了多名土豪劣紳、地方官吏。例如平?jīng)鑫渖钫窕?、靈州呂廷桂和苗維新等人。在諸多官員中，最有名的當(dāng)屬按察使史念祖，因?yàn)闅⒔祷乇蛔笞谔膹椲懒T官（后任云南按察使、布政使，廣西巡撫等職）。自此以后，史念祖成為地方督撫級(jí)人物中最公開反對(duì)并咒罵左宗棠的官員。

在民族政策中，左宗棠還非常尊重回民風(fēng)俗文化。有個(gè)叫趙履祥的縣丞竟然提出了一套同化方案。左宗棠斷然否定，并積極支持回民修建清真寺。為了保護(hù)回民不被一些勢(shì)力尋仇，他還在回民聚集地設(shè)立通判一職，而這些官職一般都是在知府一級(jí)設(shè)立的官職，基本由回民擔(dān)任，在這些官職內(nèi)還組織了一定數(shù)量的民團(tuán)組織，以回民民兵的形式保衛(wèi)回民。

左宗棠1880年離開蘭州后，他的民族政策換來了陜甘長期和平。直到20世紀(jì)四十年代，甘肅河州一代的回民在解決糾紛的時(shí)候都還執(zhí)行左宗棠的章程。青海地區(qū)的蒙回藏各民族仍然十分尊敬左宗棠，而極為痛恨年羹堯。

陜甘問題解決后，新疆問題必須提上日程了。然而，左宗棠卻連續(xù)數(shù)次回絕清廷進(jìn)兵的命令，反而專心搞起了地方建設(shè)。