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《想當廚子的生物學家是個好黑客》第11章(2)

想當廚子的生物學家是個好黑客 作者:(美)馬庫斯·烏爾森


現(xiàn)在,中產階級的消費者都有機會了解人類基因組的全部30億堿基對,科學界也以同樣的速度擴展著對這些堿基背后含意的理解??焖俚腄NA測序讓科學家能夠著手對個體遺傳差異進行廣泛的研究,這些研究揭示了具體基因的實際功能,以及它們會給健康帶來何種風險。這些研究已經(jīng)讓人類深刻理解了肥胖、精神疾病、致命疾病、日常行為等內容。即使現(xiàn)在,我們自身幾乎沒有信息能夠躲過遺傳審查。幾乎沒有遺傳學家會斷言先天完全決定后天,但是大多數(shù)人都主張,基因永遠是兩者關系的關鍵。

長久以來,直線下跌的DNA測序價推動了這樣一種預測,即很快每個人的醫(yī)療記錄上都會附帶一份本人的完整基因組信息。一些商業(yè)機構將數(shù)百萬資金押寶在所謂的個性化醫(yī)療,以及基因的破譯能更好地診斷、治療和預防疾病這樣的希望上。而對于生物黑客來說,廉價的DNA掃描對于他們的意義不止如此。

“一旦給環(huán)境中的DNA測序價格變得只有5美元這樣便宜,大家肯定會等不及要給能測序的都測了。”麥肯齊·考威爾對我說。

現(xiàn)在,5美元只能讓你解讀一條DNA鏈上大約20個堿基的順序。這點信息太少了,不足以解讀出什么有價值的東西。而且,你要讀取信息的DNA樣品中,必須包含同樣基因序列的無數(shù)個拷貝,同時樣品也必須達到相當?shù)募兌?。如果樣品中混雜了太多其他基因的片段,這會使DNA掃描異常,導致讀出不準確的序列。

由于第三代測序技術的出現(xiàn),上述限制條件如今都變得不那么嚴格了,同時,測序價格也大大降低。隨著軟件可以盡量預測你要測定的類型和你的關注點是什么,最新的測序技術能夠利用精細的算法過濾掉遺傳噪音。隨著這項技術不斷改進,即時測序的能力也逐漸提高。對那些想要知道自己把何種微生物帶進了實驗室的生物黑客來說,他們只需要用棉簽蹭一蹭鞋底,把樣品裝在小管子里寄出來就可以了。他們隨后就能收到一封電子郵件,里面詳盡地展示出他們發(fā)現(xiàn)的那些生物的DNA序列,而一條序列的價格不過是幾美元而已。


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