戰(zhàn)爭到來了，南街關(guān)于戰(zhàn)爭的話題也變得火熱起來。隨著英國和拿破侖的戰(zhàn)爭逐漸達(dá)到高潮，強(qiáng)行征用美國水手的步伐也在加快，英國皇家海軍根據(jù)《樞密令》扣押美國船只的野蠻行為也在升級。 1811年，美國總統(tǒng)號軍艦（President）與英國皇家海軍的小貝特號（ Little Belt）交火，工人們在紐約海港修建了一系列的防御工事。 1812年 2月，麥迪遜總統(tǒng)再次禁止從英國進(jìn)口貨物。 6月18日，國會向英國宣戰(zhàn)。

戰(zhàn)爭一度顯得進(jìn)展順利。美國龐大的小型驅(qū)逐艦（裝配有 44架機(jī)槍，而英國的標(biāo)準(zhǔn)配置是 38架）與傳說中的英國皇家海軍交戰(zhàn)，獲得了一部分規(guī)模較小但激動人心的勝利。 1813年 1月 1日，美國艦隊(duì)得意洋洋地帶著被俘虜?shù)鸟R其頓號（ Macedonian）駛?cè)爰~約港，無數(shù)的人在港口歡呼迎接。在戰(zhàn)爭爆發(fā)的最初兩年內(nèi)，科尼甚至還得到了額外的工作機(jī)會。英國人對美國港口進(jìn)行了封鎖，沿海商船的主人們害怕在沿著新澤西州海岸航行時(shí)被抓住，因此貨物開始從紐約往南走，經(jīng)過科尼熟悉的曼哈頓與史坦頓島之間的路線，一直到達(dá)亞瑟水道（ Arthur Kill）和范庫爾水道（ Kill Van Kull），那時(shí)，英國的艦隊(duì)尚未進(jìn)入那塊地域（貨物從陸路穿過新澤西州，然后沿著特拉華河受保護(hù)的水域而行）。單單 1813年一年，就有大約 1 500架四輪馬車沿著這條路線來回運(yùn)貨，為紐約的船夫提供了充沛的工作機(jī)會。

但總體而言，1813年，美國不管是在軍事方面還是商業(yè)領(lǐng)域都遭到了挫折。 5月，英國皇家海軍加強(qiáng)了封鎖，甚至有一支突襲隊(duì)在桑迪胡克登陸。當(dāng)時(shí)的加拿大尚是英國的殖民地。在美加交界的邊境線上，美國軍隊(duì)扭轉(zhuǎn)了戰(zhàn)爭局勢。美軍 9月 10日在伊利河上大勝英國艦隊(duì)，這難得的好運(yùn)讓紐約市上下歡欣雀躍。市民在 10月 4日舉行了慶?；顒?，家家戶戶的窗口都點(diǎn)亮了蠟燭，樂隊(duì)在市政廳的陽臺上進(jìn)行表演，停泊在港口的炮艇上懸掛著五顏六色的燈籠，火箭式空中大煙火照亮了整個夜空。

據(jù)說在這段時(shí)間內(nèi)，科尼無比勇敢，技術(shù)極其嫻熟，而且在競爭中毫不畏縮。在一個吹捧他的故事中，他受雇將部隊(duì)士兵從里士滿港運(yùn)送到曼哈頓。一艘競爭者的船只與他并排行駛，一位軍官從那艘船來到科尼的船上，要求所有士兵到另一艘船上“接受檢查”?？颇嵘钚胚@是搶生意的詭計(jì)，因而拒絕讓士兵離開。軍官大怒，拔出了自己的佩劍。而男孩科尼用手肘向軍官的臉上掃去，抓住他瘦小的身體，把他丟回到了那艘船上，然后繼續(xù)駕駛自己的船只前行。

這個故事描述了一個狡猾和好戰(zhàn)的年輕人形象，而他的這些特征在后來盡人皆知，因而當(dāng)故事在數(shù)十年后傳開時(shí)，沒有人對此表示懷疑。而其他故事就顯得更為可疑了。一個故事稱，英國皇家海軍在 1813年秋天企圖穿過海港的外圍防御工事，小規(guī)模的戰(zhàn)斗已經(jīng)爆發(fā)，一場暴風(fēng)雨橫掃了整個海灣，里士滿港的司令官認(rèn)為必須緊急通報(bào)紐約總部。司令官對科尼的聲譽(yù)有所耳聞，便派人去找他。當(dāng)他詢問船只是否能穿越這場風(fēng)暴時(shí)，那個年輕人回答說：“可以，只要操作得當(dāng)?！辈⑶已a(bǔ)充說：“部分路段必須在吃水線以下航行。 ”結(jié)果，他取得了成功。

之后不到五年，科尼又成功穿過另一場風(fēng)暴，新聞媒體對他的技巧和膽量進(jìn)行了報(bào)道和證實(shí)。但那個故事并不完全真實(shí)。一方面，英國海軍并未在1813年襲擊紐約；另一方面，科尼當(dāng)時(shí)仍然是個男孩子，駕駛的船只在法律意義上屬于其父親，而且紐約港到處都是技術(shù)嫻熟的水手，要說他的名聲超出了其他水手，這一點(diǎn)讓人難以相信。應(yīng)該說，當(dāng)時(shí)的他正在努力擺脫父親的影子，開始樹立自己的聲譽(yù)。