當(dāng)華興會(huì)和科學(xué)補(bǔ)習(xí)所在兩湖地區(qū)積極開展革命活動(dòng)的同時(shí)，浙江地區(qū)的革命黨人也在積極聯(lián)絡(luò)會(huì)黨，加緊策劃反清革命的活動(dòng)。

以蔡元培為會(huì)長的光復(fù)會(huì)就是東南地區(qū)反清革命的主要團(tuán)體。

光復(fù)會(huì)成立的基礎(chǔ)，是留日的浙江籍學(xué)生。

1903年10月，在東京的一批浙江籍的留學(xué)生、浙學(xué)會(huì)會(huì)員聚集在《浙江潮》編輯王偉人的寓所，商討組織秘密的革命團(tuán)體，決定用暴力發(fā)動(dòng)武裝起義。他們認(rèn)為，應(yīng)該先選擇湖南、安徽或浙江一省，實(shí)行武裝占領(lǐng)，作為根據(jù)地，再逐漸擴(kuò)大。最后認(rèn)為要另組一革命團(tuán)體，應(yīng)邀請(qǐng)浙江志士。這是光復(fù)會(huì)的最早發(fā)端。

1903年9月上旬，蔡元培自青島返滬。10月，沙俄軍隊(duì)重占奉天，國內(nèi)重新掀起拒俄高潮，蔡元培等在滬發(fā)起了拒俄同志會(huì)，力爭領(lǐng)導(dǎo)這一運(yùn)動(dòng)。12月，他們發(fā)刊了報(bào)紙《俄事警聞》，《俄事警聞》代替了已?？摹秶袢?qǐng)?bào)》。1904年2月，日俄戰(zhàn)爭爆發(fā)，蔡元培等又適時(shí)地將拒俄同志會(huì)改名為爭存會(huì)，號(hào)召反對(duì)帝國主義列強(qiáng)的瓜分政策，爭取中華民族的生存權(quán)利。同時(shí)，《俄事警聞》也易名《警鐘日?qǐng)?bào)》。5月1日，中國教育會(huì)舉行第三次大會(huì)，蔡元培重新出任會(huì)長。7月，蔡元培又任愛國女學(xué)校校長。愛國女學(xué)校補(bǔ)訂章程，標(biāo)明“以增進(jìn)女子之智德體力，使有以副其愛國心為宗旨”，增強(qiáng)了政治性。中國教育會(huì)和愛國女學(xué)校仍被各地革命黨人當(dāng)做秘密聯(lián)絡(luò)機(jī)關(guān)。

不久，光復(fù)會(huì)成立，會(huì)址設(shè)上海，推蔡元培為會(huì)長。它的入會(huì)誓詞是：

光復(fù)漢族，還我河山，以身許國，功成身退。

可以看出，這個(gè)誓詞的核心是“光復(fù)”二字。

光復(fù)會(huì)成立后，圍繞發(fā)展組織，聯(lián)絡(luò)會(huì)黨，密謀起義，暗殺清貴權(quán)四個(gè)方面開始展開工作。