在這場跨世紀的反恐斗爭中，俄羅斯付出了4000多名將士生命和上千億美元資金的高昂代價，安全部門也積累了不少寶貴經(jīng)驗。

經(jīng)驗之一：平叛與反恐不可分割

車臣軍事行動前期以鎮(zhèn)壓武裝叛亂為主，后期以反恐為主。

在軍事行動開始前，安全會議研究了以色列建國前在巴勒斯坦境內(nèi)的武裝行動，巴勒斯坦激進分子在以色列境內(nèi)的襲擊行動，以及東歐劇變后阿爾巴尼亞族武裝分子在科索沃的行動，發(fā)現(xiàn)其手法與車臣武裝分子相同。

俄軍指揮部重視戰(zhàn)術(shù)手法的運用。例如，把武裝分子引到布雷區(qū)聚而殲之，深入武裝分子后方搞突襲。

在平叛階段，國防部、內(nèi)務部、安全局和緊急情況部這四大強力部門協(xié)同作戰(zhàn)，以國防部為主，其余各部在行政上服從軍事首長；在隨后的反恐階段，則以內(nèi)務部和安全局為主，重視心理戰(zhàn)、信息戰(zhàn)和新聞戰(zhàn)的作用、地位和功能。

經(jīng)驗之二：“以車治車”

安全會議曾提出兩條建議，一是盡可能廣泛地吸收忠于中央政府的當?shù)剀娛禄瘷C構(gòu)和居民參與平叛行動；二是在國防軍和內(nèi)衛(wèi)部隊摧毀車臣武裝分子主力后，讓沖突“車臣化”，爭取車臣非法武裝的上層分子和動搖分子。

2000年普京任命曾經(jīng)同情非法武裝的車臣大穆夫提艾哈邁德·卡德羅夫為車臣行政首腦（后為車臣總統(tǒng)）。2004年5月老卡德羅夫死于恐怖襲擊后，又讓他的兒子任總理，隨后任總統(tǒng)。如今小卡德羅夫手下主要官員八成以上來自原先的車臣分裂主義分子。

2010年5月，時任總統(tǒng)梅德韋杰夫支持在北高加索恢復長老會議制度的主張，以改善當?shù)胤ㄖ巍?/p>

經(jīng)驗之三：“花錢打不如花錢養(yǎng)”

打的代價是4000多軍人犧牲、數(shù)萬平民傷亡、數(shù)十萬人流離失所、53％的家庭失去親人、上千億美元的軍事開支和財產(chǎn)損失。重建車臣的聯(lián)邦開支，2001年-2011年這11年的總和也遠遠不到100億美元。2001年為24億盧布（當時31盧布合1美元），2002年增加到45億盧布（車臣當年GDP僅40億盧布），后來增加到每年100多億盧布，2008年-2011年共撥1206億盧布。