克林頓就職時受到了兩件意外窘事的影響，給他最初階段的總統(tǒng)工作蒙上了陰影。早在權力交接階段，克林頓便宣布打算任命一名女性為司法部長這個內閣中的關鍵職位之一。不過，他不得不放棄了第一次提名的人選，因為事實證明她不僅雇用了兩個非法居留的外國人料理家務，而且沒有為他們繳納社會安全稅。直到1993年2月的第二周，克林頓才最終提名后來順利獲任的人選：珍妮特·里諾（Janet Reno）。此外，克林頓宣布將兌現(xiàn)另一個宣傳力度較低的競選承諾：要求軍隊廢除禁止同性戀服役的政策。這個決定遭到了持續(xù)的密集抗議，克林頓被迫收回成命，179允許軍方開除公開的同性戀者，但同時指示軍方在征兵時不要詢問應征者的性取向。

百日之期向來被視為檢驗新總統(tǒng)是否順利適應了他的本職工作的標尺。但克林頓在就職百日期滿之時，能出麻煩的地方悉數(shù)出了麻煩。一項對克林頓的立法計劃至關重要的經(jīng)濟刺激法案未獲國會通過，媒體上更充斥著關于克林頓政府各種失誤的報道，這些失誤有的確有其事，有的則是無中生有。其中有報道稱，由于一名好萊塢美發(fā)師在“空軍一號”上給克林頓理發(fā)，洛杉磯國際機場的大量航班被迫延誤。到1993年6月時，克林頓的支持率已從最初的58%下滑了20個百分點。

就在政界開始看空克林頓時，他卻顯示出了強大的自我糾錯能力，而這向來是他的顯著特征?？肆诸D先是將大量深諳華盛頓游戲規(guī)則的專業(yè)人士招致麾下，充實白宮工作班子，而此前的白宮主要由來自阿肯色州和競選時的那些助手把持。他同時也開始充分發(fā)揮自己的政治技巧和演講技巧。到1993年年底，克林頓不僅贏得了一份來之不易的預算協(xié)議，還向參眾兩院聯(lián)席會議發(fā)表了一份令人驚艷的演說，闡述他對醫(yī)療保險體制進行改革的設想。在他的斡旋之下，里程碑式的北美自由貿易協(xié)定（North American Free Trade Agreement, NAFTA）順利通過；他還在白宮南草坪主持了以色列總理伊扎克·拉賓（Yitzhak Rabin）與巴勒斯坦解放組織主席亞西爾·阿拉法特（Yasir Arafat）簽署和平協(xié)定的儀式。