1924年，美國華盛頓史密森研究院佛利爾藝術(shù)館（The Freer Gallery of Att），派畢士博（C.W.Bishop）率領(lǐng)一個代表團來中國進(jìn)行考古發(fā)掘和研究，鑒于李濟在學(xué)術(shù)界日漸興隆的名聲及他在中國近現(xiàn)代考古學(xué)史上所作的最早貢獻(xiàn)，畢士博由北京的團部寫信至天津南開大學(xué)邀請李濟加入他們在北京的考古工作隊。李濟當(dāng)時認(rèn)為自己“雖說是在美國作過五年學(xué)生，但與外國人沒共過事。”因而當(dāng)收到信時，頗為躊躇，最后“就決定請教‘丁大哥’去。”丁文江認(rèn)真聽完李濟的陳述后，直截了當(dāng)?shù)卣f：“教書固然是很好，研究更為重要。”因而主張李選擇研究工作，并且列舉了幾件很顯赫的事例，以證明他如此看的理由。同時丁告訴李，與外國人相處，重要的是“直道而行”，且“開始就把條件講清楚。”[12]聽了丁文江的“箴言”，李濟決定與對方合作，他在給畢士博的回信中，首行提出了合作的兩個決定條件：“一個是在中國做田野考古工作，必須與中國的學(xué)術(shù)團體合作；一個是在中國掘出的古物，必須留在中國。”畢士博接信后即回華盛頓，向他的上司——弗利爾藝術(shù)館館長洛奇匯報，順便將李濟贊揚一番，終于達(dá)成一致意見。不久，李濟收到畢士博的回信，稱：“我們可以答應(yīng)你一件事，那就是我們決不會讓一個愛國的人，做他所不愿做的事”。[13] 李濟對這個答復(fù)很滿意，于是便辭去南開的教職，于1925年初，加入畢士博等人的行列，從而開創(chuàng)了“既維護(hù)主權(quán)，又公平合作”，利用外資搞科研的先河，為后來著名的“殷墟第二、三次發(fā)掘的資金問題的解決”（李濟語）打下了基礎(chǔ)。 

就在李濟加入畢士博考古工作隊不久，清華國學(xué)研究院也鳴鑼開張，作為清華大學(xué)籌備處顧問的丁文江，意識到清華未來的光輝前景，建議李濟去研究院一邊任教一邊做研究工作，并把情況介紹給老朋友梁啟超，二人共同出面向清華校長曹云祥推薦，曹一聽李濟的經(jīng)歷和名聲，立即決定聘請。于是，時年29歲的李濟，以講師的身份出任國學(xué)研究院導(dǎo)師。