智顗在玉泉寺四年，主要講《法華玄義》和《摩訶止觀》，然后由灌頂記錄整理成書，成為天臺(tái)宗的主要經(jīng)典。《法華玄義》是對(duì)《法華經(jīng)》的理解，《摩訶止觀》是講禪法的。摩訶是梵文，意為大，“止”為停息，“觀”是智慧。是指教理與修證兩大部門，稱教觀二門。

看來(lái)智顗是一心要在創(chuàng)立宗派上做文章的，在江都，只能是楊廣的家僧，所以他要離開(kāi)。他在這里收了很多弟子。據(jù)說(shuō)他一生造寺三十六所，度僧一萬(wàn)四千余人，親傳弟子三十二人。在玉泉寺就有不少。大概是他比較開(kāi)心的時(shí)候，講《妙法蓮華經(jīng)》一個(gè)“妙”字，能講九十多天。

開(kāi)皇十三年（公元593年）二月二十二日，楊廣入朝，行至陜州（治所今河南陜縣），又遣使送去親筆信往荊州奉迎智顗，稱自己“馳仰之誠(chéng)與時(shí)而積”，越來(lái)越想念了。

五月，智顗派弟子奉書報(bào)晉王，送上新建玉泉伽藍(lán)（寺廟）圖，獻(xiàn)上相傳是外國(guó)獻(xiàn)給梁武帝的珍貴“萬(wàn)春樹(shù)皮袈裟”。楊廣收到禮物后就修書一封表示感謝，并以豐厚的禮單表示回報(bào)。文帝也敕書匾額，賜智顗創(chuàng)辦的精舍名曰“玉泉寺”，并敬問(wèn)道體，也就是身體如何。

荊州繼任總管王積慌了神，急忙隨即到山上禮拜，境況大為改觀了。據(jù)說(shuō)王積上山禮拜，見(jiàn)到智顗后渾身出汗、顫抖。王積身經(jīng)百戰(zhàn)，未曾怵過(guò)，此次竟會(huì)這樣，令人非常不解。

楊廣始終想著要智顗入江都。又三番寫信派人迎接智顗，一定要見(jiàn)到師父。沒(méi)有辦法，智顗只好在595年二月到了金陵。

智顗始終不愿住進(jìn)慧日道場(chǎng)，先到金陵棲霞寺，后又來(lái)到江都城外禪眾寺。大概就是不愿做楊廣的籠中鳥(niǎo)。面對(duì)智顗的風(fēng)骨，楊廣轉(zhuǎn)而希望大師傳授佛法。兩次修書向智顗問(wèn)禪法，很可能想成為智者傳燈弟子，智者頻辭不免，乃著《凈名經(jīng)疏》，此經(jīng)疏是對(duì)《維摩詰經(jīng)》作的注解。

七月，智顗以所著《凈名經(jīng)疏·初卷》奉送晉王，楊廣很高興地接受了，但他進(jìn)一步要智顗授禪傳燈卻遭到了斷然拒絕。其后一段時(shí)間，智顗的活動(dòng)受到了監(jiān)視。這從他去世前寫給楊廣的信中可以看出。“今出期既斷，法門亦絕。”不讓他出去傳法，法門就絕了。他很憤慨，這是信中“六恨”之一，也是人們對(duì)智顗死因猜測(cè)的一個(gè)依據(jù)。