我素來不贊成董仲舒“罷黜百家，獨(dú)尊孔氏”的主張。清代教育宗旨有“尊孔”一款，已于民元在教育部宣布教育方針時(shí)說他不合用了。到北大后，凡是主張文學(xué)革命的人，沒有不同時(shí)主張思想自由的；因而為外間守舊者所反對。適有趙體孟君以編印明遺老劉應(yīng)秋先生遺集，貽我一函，屬約梁任公、章太炎、林琴南諸君品題；我為分別發(fā)函后，林君復(fù)函，列舉彼對于北大懷疑諸點(diǎn)。我復(fù)一函，與他辯。這兩函頗可窺見那時(shí)候兩種不同的見解。

這兩函雖僅為文化一方面之攻擊與辯護(hù)，然北大已成為眾矢之的，是無可疑了。越四十余日，而有五四運(yùn)動(dòng)。我對于學(xué)生運(yùn)動(dòng)，素有一種成見，以為學(xué)生在學(xué)校里面，應(yīng)以求學(xué)為最大目的，不應(yīng)有何等政治的組織。其有年在二十歲以上，對于政治有特殊興趣者，可以個(gè)人資格參加政治團(tuán)體，不必牽涉學(xué)校。所以民國七年夏間，北京各校學(xué)生，曾為外交問題，結(jié)隊(duì)游行，向總統(tǒng)府請?jiān)福划?dāng)北大學(xué)生出發(fā)時(shí)，我曾力阻他們，他們一定要參與；我因此引咎辭職，經(jīng)慰留而罷。到八年五月四日，學(xué)生又有不簽字于巴黎和約與罷免親日派曹、陸、章的主張，仍以結(jié)隊(duì)游行為表示，我也就不去阻止他們了。他們因憤激的緣故，遂有焚曹汝霖住宅及攢毆章宗祥的事，學(xué)生被警廳逮捕者數(shù)十人，各校皆有，而北大學(xué)生居多數(shù)。我與各專門學(xué)校的校長向警廳力保，始釋放。但被拘的雖已保釋，而學(xué)生尚抱再接再厲的決心，政府亦且持不做不休的態(tài)度。都中宣傳政府將明令免我職而以馬其昶君任北大校長，我恐若因此增加學(xué)生對于政府的糾紛，我個(gè)人日將有運(yùn)動(dòng)學(xué)生保持地位的嫌疑，不可以不速去。乃一面呈政府，引咎辭職，一面秘密出京。時(shí)為五月九日。

那時(shí)候?qū)W生仍每日分隊(duì)出去演講，政府逐隊(duì)逮捕，因人數(shù)太多，就把學(xué)生都監(jiān)禁在北大第三院。北京學(xué)生受了這樣大的壓迫，于是引起全國學(xué)生的罷課，而且引起各大都會(huì)工商界的同情與公憤，將以罷工罷市為同樣之要求。政府知?jiǎng)莶豢晌?，乃釋放被逮諸生，決定不簽和約，罷免曹、陸、章，于是五四運(yùn)動(dòng)之目的完全達(dá)到了。

五四運(yùn)動(dòng)之目的既達(dá)，北京各校的秩序均恢復(fù)，獨(dú)北大因校長辭職問題，又起了多少糾紛。政府曾一度任命胡次珊君繼任，而為學(xué)生所反對，不能到校；各方面都要我復(fù)職。我離校時(shí)本預(yù)定決不回去；不但為校務(wù)的困難，實(shí)因校務(wù)以外，常常有許多不相干的纏繞，度一種勞而無功的生活，所以啟事上有“殺君馬者道旁兒；民亦勞止，汔可小休；我欲小休矣”等語。但是隔了幾個(gè)月，校中的糾紛，仍在非我回校不能解決的狀態(tài)中，我不得已，乃允回校?；匦Ｒ郧?，先發(fā)表一文，告北京大學(xué)學(xué)生及全國學(xué)生聯(lián)合會(huì)，告以學(xué)生救國，重在專研學(xué)術(shù)，不可常為救國運(yùn)動(dòng)而犧牲。到校后，在全體學(xué)生歡迎會(huì)演說，說明德國大學(xué)學(xué)長、校長均每年一換，由教授會(huì)公舉；校長且由神學(xué)、醫(yī)學(xué)、法學(xué)、哲學(xué)四科之教授輪值；從來生過糾紛，完全是教授治校的成績。北大此后亦當(dāng)組成健全的教授會(huì)，使學(xué)校決不因校長一人的去留而起恐慌。

那時(shí)候蔣夢麟君已允來北大共事，請他通盤計(jì)劃，設(shè)立教務(wù)、總務(wù)兩處，及聘任財(cái)務(wù)等委員會(huì)，均以教授為委員。請蔣君任總務(wù)長，而顧孟余君任教務(wù)長。