毛澤東因此掌握了主動(dòng)，但是在會(huì)議上造成一場騷動(dòng)的，卻是林彪。他在會(huì)議結(jié)束之前，突然指控黨的宣傳部長陸定一和書記處成員楊尚昆陰謀發(fā)動(dòng)“反革命政變”，并呼吁徹底調(diào)查他們的行為。他宣稱為了挫敗他們的陰謀，他已經(jīng)征得毛澤東的同意，派遣軍隊(duì)進(jìn)駐北京的廣播電臺(tái)和“公安單位”。在這次會(huì)議的幾個(gè)月之后，毛澤東在寫給江青的信中說，林彪所說的話令他大吃一驚。盡管毛澤東可能真的大吃一驚，卻不能使陸定一和楊尚昆免逃幾乎立即被捕的命運(yùn)。

在打敗彭真和書記處后，毛澤東似乎應(yīng)該返回北京了。但他卻決定繼續(xù)留在杭州，讓劉少奇和鄧小平去發(fā)動(dòng)這場文化大革命！這使劉、鄧兩人很不愿意，但卻又不得不做的一件事。毛澤東究竟是想要給他們一個(gè)將功贖罪的機(jī)會(huì)，或只是丟給他們一條繩子，要他們自縛手腳，這又是另外一個(gè)謎，而且可能永遠(yuǎn)也無法找到答案。即使他們想彌補(bǔ)過失，但他們的做法也錯(cuò)了。他們不是去努力迎合毛的意見，相反，他們計(jì)劃實(shí)施一項(xiàng)政策，其做法幾乎是劉少奇在社會(huì)主義教育運(yùn)動(dòng)中起草的《后十條（修正案）》的翻版。他們派遣了數(shù)百個(gè)工作組到北京的中學(xué)和大學(xué)，要求他們建立文化革命委員會(huì)，并指導(dǎo)文化革命委員會(huì)調(diào)查、搜集學(xué)校教師和管理人員過去和目前有無修正主義的傾向和證據(jù)，但并沒想把群眾卷進(jìn)去。

這種做法，從一開始就受到林彪、康生和陳伯達(dá)等人的破壞。通過各機(jī)構(gòu)的軍宣隊(duì)，以及學(xué)校和大學(xué)的軍代表，他們?nèi)税延杀驹擖h委控制的自上而下的清理工作變成自下而上的對(duì)領(lǐng)導(dǎo)和教師的揭發(fā)和攻擊。他們動(dòng)員學(xué)生示威游行，反對(duì)他們的師長，并要求把“牛鬼蛇神”揪出來批判，即使是黨的高級(jí)干部也不能例外。到了6月初，由“好”的（非資產(chǎn)階級(jí)）階級(jí)背景的學(xué)生組成的一隊(duì)又一隊(duì)的紅衛(wèi)兵，已經(jīng)布滿整個(gè)北京市，并開始和工作小組發(fā)生沖突。在幕后，林彪等人也展開積極行動(dòng)。他們改組北京市委，并且派軍宣傳隊(duì)接管了《人民日?qǐng)?bào)》。

劉少奇和鄧小平很快就發(fā)現(xiàn)，他們所面臨的這項(xiàng)動(dòng)亂，是毛澤東最親信的人發(fā)動(dòng)的。因此他們前往杭州見毛澤東，請(qǐng)他作指示。但毛澤東只是建議他們，不要太過倚賴工作小組或把他們當(dāng)作革命工具，其余的事情由他們自行決定。他們既然不能拒絕擔(dān)負(fù)起更進(jìn)一步的責(zé)任（這樣做等于違背了黨的紀(jì)律），只好采取唯一可行的做法，回到北京，向紅衛(wèi)兵宣戰(zhàn)。他們下達(dá)兩項(xiàng)命令，禁止學(xué)生與教師秘密集會(huì)，并宣布所有的紅衛(wèi)兵組織為非法。這項(xiàng)措施取得了效果，工作小組受到鼓舞，全力反攻，阻止紅衛(wèi)兵走上街頭。但對(duì)于軍方所控制的一切，鄧小平和劉少奇卻束手無策。

在這種情況下，毛澤東終于回到北京。途中，他在武漢游過將近一里寬的長江。雖然從照片上看起來，他其實(shí)是浮在水面上飄過長江，而不是真正游泳，但這對(duì)一個(gè)已經(jīng)72歲的老人來說，畢竟是不簡單的。在隨后而來的宣傳中，他被描述為像是超人一般。在陳伯達(dá)和其屬下宣傳人員多年來的不懈努力下，對(duì)毛澤東的個(gè)人崇拜，在這時(shí)候達(dá)到最頂峰。他開始被描述成具有神奇力量的人。在美術(shù)作品里，他的形象被畫得比四周的人都要高大。他成了人民心目中的“最紅最紅的紅太陽”。