1918年到1923年，作為胡塞爾的助手，海德格爾除了接受胡塞爾現(xiàn)象學(xué)的指導(dǎo)和主持研究班的討論外，還先后講授了現(xiàn)象學(xué)、對亞里士多德的現(xiàn)象學(xué)解釋等課程。這一過程不僅使他真正了解了胡塞爾現(xiàn)象學(xué)的本質(zhì)內(nèi)容和根本缺陷，而且使他獲得了未來研究存在問題的現(xiàn)象學(xué)方法。

對存在問題的興趣的不斷增長與現(xiàn)象學(xué)方法結(jié)合，促使海德格爾走上了追問存在的道路，而在此期間人類社會發(fā)生的各種重大事件（特別是第一次世界大戰(zhàn)）對個體和人類的生存提出的尖銳深刻的疑問，由叔本華和尼采的唯意志論、狄爾泰的生命哲學(xué)、克爾凱郭爾的個體存在哲學(xué)等構(gòu)成的現(xiàn)代早期人學(xué)大潮的涌動，無形地規(guī)定了海德格爾的存在之思必然又是人學(xué)之思。

1922年，由于胡塞爾的再次大力推薦支持，海德格爾再次申請馬堡大學(xué)的副教授職位，馬堡大學(xué)的那托普和哈特曼認(rèn)為他關(guān)于亞里士多德的講稿寫得有創(chuàng)造性，故也極力推薦他為第一候選人。1923年6月，他當(dāng)上了馬堡大學(xué)的副教授。

在馬堡大學(xué)的五年即1923年至1928年，海德格爾的收獲同樣十分巨大。馬堡大學(xué)是新康德主義馬堡學(xué)派的所在地，海德格爾與那托普、哈特曼等一流哲學(xué)家經(jīng)常進行哲學(xué)討論，大大擴展了他的哲學(xué)視野，同時，由于講授和研究了柏拉圖、亞里士多德的哲學(xué)以及時間觀念的歷史，使他對存在與時間的思考逐漸形成了體系。因此，1927年2月，他的《存在與時間》的第一部，作為胡塞爾主編的《哲學(xué)與現(xiàn)象學(xué)研究年鑒》的特刊公開問世。這使海德格爾名聲大振，很快他被認(rèn)為是德國最偉大的哲學(xué)家之一。

1928年至1946年，是海德格爾的思想與生活中一段非同尋常的時期。

1928年，在胡塞爾的推薦下，海德格爾接替年屆退休的胡塞爾的教授職位，重返弗萊堡大學(xué)。然而也只是在這之后，胡塞爾才認(rèn)真研讀了海德格爾的《存在與時間》，真正明白了他與海德格爾分歧的根本性。1931年，胡塞爾公開表示與海德格爾決裂。

1933年，希特勒納粹上臺執(zhí)政，弗萊堡校長被迫辭職，作為哲學(xué)家的海德格爾似乎第一次交上了“官運”。原校長勸說海德格爾出來競選校長，結(jié)果海德格爾被選上。按理說，哲學(xué)家是有著深刻智慧的人，對現(xiàn)實政治應(yīng)該有清醒的認(rèn)識，但此時的海德格爾似乎并不清醒。他在以《德國大學(xué)的自我主張》為標(biāo)題的校長就職演說以及其他講話中，把納粹的國家社會主義看做是一場徹底的革命，認(rèn)為它代表著人類的未來希望，說希特勒是德國現(xiàn)在和將來的現(xiàn)實，并且自己也加入了納粹黨。雖然他可能的確沒有按照納粹的要求去迫害猶太人和燒毀猶太人寫的著作，雖然他因教育主張與納粹的教育綱領(lǐng)不同而在1934年2月辭去大學(xué)校長的職務(wù)，但這段曇花一現(xiàn)的“輝煌”，總是不斷招來后人對他的貶低和非難。

可想而知，海德格爾這時的心情是如何復(fù)雜，如何不平靜。他的思想的動蕩和轉(zhuǎn)變也正是在此之后（1935年）開始的。尖銳動蕩的社會現(xiàn)實，無法預(yù)料的個人前途，使海德格爾的腦海無法不去思考現(xiàn)代人類生存的必然性問題。從形而上學(xué)的追根到藝術(shù)作品的探源，從對哲學(xué)的探索（1936—1938年）到對人本主義的解剖，從對謝林的人類自由理論的分析到對尼采的權(quán)力意志理論的研究，從對荷爾德林的詩篇的挖掘到對赫拉克利特邏各斯學(xué)說的探討，從對抽象的哲學(xué)理論的反思到對現(xiàn)代人類歷史的追問，無一不浸透著他對人類前途的關(guān)懷。用他自己的話說，他的心靈激烈震蕩了十年之久。

第二次世界大戰(zhàn)德國戰(zhàn)敗后，海德格爾因被認(rèn)為有“納粹之嫌”而被法軍禁止上課，直到1951年禁令撤銷。