中世紀(jì)以后，笛卡兒和斯賓諾莎繼承亞里士多德的傳統(tǒng)，以形而上學(xué)的推理解釋上帝、證明上帝的存在。他們聲稱(chēng)，形而上學(xué)的推理可以像幾何學(xué)一樣清晰和不可辯駁?？档聟s認(rèn)為，人無(wú)法證明與上帝有關(guān)的事物，人無(wú)法證明與真實(shí)存在有關(guān)的事物，人無(wú)法證明事物本身的本質(zhì)。康德說(shuō)，人只能證明與具體事物有關(guān)、與視覺(jué)世界和現(xiàn)象世界有關(guān)的事物。因此，表面看來(lái)，康德的形而上學(xué)似乎對(duì)宗教并不友好。但是，仔細(xì)觀察，我們就會(huì)發(fā)現(xiàn)并非如此。按照康德的理論，雖然宗教無(wú)法被證實(shí)，但宗教信仰還是有理由存在的。人無(wú)法證明上帝存在，人也無(wú)法證明上帝不存在。對(duì)康德來(lái)說(shuō)，宗教不是一門(mén)理性的學(xué)說(shuō)，而是一種信仰。至此，形而上學(xué)仍然是宗教的伙伴。

開(kāi)始于巴門(mén)尼德的形而上學(xué)與宗教之間的長(zhǎng)期聯(lián)盟終于在叔本華這里截止。叔本華贊同早期形而上學(xué)理論家關(guān)于具體事物的世界或感知世界是虛幻的這一理論。叔本華與他們的分歧在于他的關(guān)于真實(shí)存在和終極現(xiàn)實(shí)的論述。早期形而上學(xué)理論家把真實(shí)存在等同于上帝，但是，叔本華卻說(shuō)，真實(shí)存在是“意志”。在無(wú)生命的物體中，這個(gè)意志表現(xiàn)為體積和引力。在有機(jī)生命中，這個(gè)意志表現(xiàn)為生的意志，即求生和繁殖的意志。叔本華所說(shuō)的意志與后來(lái)的思想家所說(shuō)的無(wú)意識(shí)相似。

康德為上帝的存在留有余地，叔本華卻把世界劃分為意志和思想。也就是說(shuō)，他把世界劃分為意志和人對(duì)于具體事物的看法，他沒(méi)有給上帝的存在留有任何余地。從此，形而上學(xué)不再帶有神學(xué)色彩，卻帶有心理學(xué)的色彩。在西方哲學(xué)史上，叔本華是第一位堅(jiān)定的無(wú)神論者。但是，叔本華的無(wú)神論不像尼采的無(wú)神論那樣喧囂、張揚(yáng)，他不過(guò)是先取消上帝，后以無(wú)意識(shí)代之。早期的思想家一直認(rèn)為，人基本上是有意識(shí)的和理性的。叔本華則首次宣布，人基本上是無(wú)意識(shí)的和非理性的，意識(shí)不過(guò)是無(wú)意識(shí)的表皮。

阿奎那用形而上學(xué)來(lái)證明上帝憑意志創(chuàng)造了世界。斯賓諾沙用形而上學(xué)來(lái)證明上帝不僅是隱藏于自然之中的創(chuàng)造力量，而且也就是自然本身。他認(rèn)為，上帝存在于萬(wàn)物之中。叔本華用形而上學(xué)來(lái)證明上帝是不存在的，并證明生命歸根到底是痛苦、毫無(wú)意義的痛苦?？v觀歷史，哲學(xué)家用形而上學(xué)證明各式各樣的假想，或證明他們想要證明的東西。當(dāng)形而上學(xué)的證明得出如此之多的相互矛盾的結(jié)論時(shí)，人們?cè)趺催€能相信形而上學(xué)會(huì)導(dǎo)致真理呢？