余繼登，字世用，交河人。萬歷五年(1577)的進(jìn)士。改封庶吉士，授職為檢討。參與撰修《會(huì)典》，晉升修撰，入宮講授經(jīng)書。不久，提升為右中允，充任日講官。當(dāng)時(shí)經(jīng)筵進(jìn)講長(zhǎng)期停頓，侍臣沒有辦法向皇上講忠言。余繼登與同官馮琦一起呈遞《通鑒》的講義，告誡時(shí)政缺陷、失誤。歷任少詹事兼侍讀學(xué)士，充當(dāng)正史副總裁。事后晉升為詹事負(fù)責(zé)翰林院。兩宮受災(zāi)，與諸位講官援引《洪范五行傳》誠摯勸諫。沒有答復(fù)。晉升禮部右侍郎。

　　萬歷二十六年(1598)，他以左侍郎身份負(fù)責(zé)禮部事務(wù)。陜西、山西發(fā)生地震，南京遭雷火，西寧的鐘不敲自鳴，紹興地下涌淌血水。余繼登在此年底分類上奏，順便懇請(qǐng)罷除一切害民的苛刻開采之事。當(dāng)時(shí)未被采納。雷擊了太廟的樹，再次請(qǐng)求皇上親自到京郊祭祀、祭廟，冊(cè)立嫡長(zhǎng)子，停征礦稅，撤除宦官使者。神宗下優(yōu)詔答復(fù)知道了。

　　不久晉升為本部尚書。當(dāng)時(shí)準(zhǔn)備討伐播州楊應(yīng)龍。余繼登奏請(qǐng)罷免四川的礦稅，用來資助士兵的糧餉。并再次上奏“：近來星跡失度，水旱相繼為害，白天看見太白星，上天不和順啊。鑿山開礦，裂地求砂，導(dǎo)致狄道地方山崩地震，地氣不和順啊。百姓窮困，再加苛求，錢財(cái)空乏，又索求珠寶，奸民像螞蟻般聚集，太監(jiān)囂張，朝廷內(nèi)外阻隔，上下沒有交流，人心不和睦啊。兇暴的氣息凝聚不散，結(jié)成怨毒之形，山陵河谷變遷，高低易位，這是陰氣壓陽氣、邪氣干擾正氣、下級(jí)背叛上級(jí)的氣象。我不能感動(dòng)皇上，勸諫越多皇上越厭煩，所以蒼天就用非常的變故，警戒提醒陛下，陛下又對(duì)此還能恬然不有所作為嗎？”神宗仍不理會(huì)。

　　余繼登親自部署部中事務(wù)，奏請(qǐng)冊(cè)立太子并加冠完婚。多次上疏，因?yàn)閼┱?qǐng)無效，憂郁成疾。每當(dāng)談及此事，就流淚說“：大禮不舉行，我作為禮官死不瞑目。”患病三個(gè)月，接連上奏請(qǐng)求退休，神宗不同意。懇請(qǐng)停止俸祿，也不被批準(zhǔn)。最終死于任上。追贈(zèng)太子少保，謚號(hào)文恪。

　　余繼登樸實(shí)、正直，辦事慎重、嚴(yán)密，很少言談、嬉笑。遇上大事，諫議侃侃而發(fā)。居家廉潔。學(xué)士曾朝節(jié)曾到過他家，庭徑長(zhǎng)滿蓬蒿。當(dāng)他病重，去探視他，見他身蓋粗布被，用羊皮蓋著腳部。他的小兒子參加童生考試，夫人請(qǐng)他出面講一句話，他最終沒有答應(yīng)。