五月二十六日，明智光秀返回自己的居城丹波龜山城，兩天后，明智光秀前往愛宕山的神社祈禱戰(zhàn)爭勝利，然后在寺中和連歌師里村紹巴等連歌唱和，明智光秀寫出了一句意味深長的話：“ときは今 天が下知る 五月哉?！边@個可以翻譯為：五月的天下著蒙蒙的雨。然而，這里的第一二個字“とき”正好是“土岐”的發(fā)音，“知”與“治”也同音。明智光秀據(jù)說出身美濃土岐氏，因此，該句如果不看文字，也可以理解為：“土岐は今 天（あめ）が下（した）治る（しる） 五月哉”（“土岐氏就在現(xiàn)在的五月間奪取天下！”）。在整個連歌中，光秀神思凝重，若有所思，甚至把粽子連粽葉囫圇吞了下去。第二天，即二十九日，信長從安土城出發(fā)前往京都，德川家康也離開安土前往日本的商業(yè)中心--。六月一日，信長抵達京都，在本能寺居住。

本能寺位于今天京都府的中京區(qū)，是一座法華宗寺廟。這座建于1415年的古老廟宇并不大，也沒有什么壕溝等防御設(shè)施。不過在京都，信長的確可以放心地住在廟宇里。信長興致頗好，還招來了本因坊算砂和鹿塩利玄下圍棋。明治三十七年（1904）初版的《坐隱談叢》這樣記述這場棋局：“棋勢變幻，妙手迭出，最后出現(xiàn)了‘三劫’”。所謂“三劫局”又叫“三劫連環(huán)”，在圍棋對局中同時存在三個有關(guān)勝負的劫爭，如果雙方互不相讓，只好握手言和。據(jù)說當時，滿座皆驚，認為這肯定是不祥之兆。

同日下午，明智光秀召集家臣和士兵，要求家臣訂立誓約。然后宣布：信長要在京都檢閱明智家的軍隊。于是，明智家的軍隊秘密趕往京都，許多士兵甚至認為他們的目標是正在織田家訪問的德川家康。他們?nèi)算暶恶R裹足，分三路偷偷靠近京都。到達京都附近的桂川時，明智光秀終于下達了他此行的目的：“殿下即將成為天下人！”他用嘹亮的聲音喊出了一句驚天動地改變歷史的口號：“敵在本能寺！”

六月二日凌晨，本能寺響起了槍聲，信長被喧鬧聲吵醒，下令小姓森蘭丸查看是何人作亂。森蘭丸的回報讓信長大為驚異：“橘梗旗，是惟任日向守的軍隊。”信長的小姓出戰(zhàn)，全部陣亡。信長和親信森蘭丸、森力丸等人隨后出現(xiàn)，信長先用弓箭，然后用槍抵抗，但寡不敵眾，手腕中彈，被迫退回室內(nèi)。據(jù)說信長在室內(nèi)切腹并放火燒寺，由于火勢太大，信長的尸體也下落不明。

身處不遠處妙覺寺中的信長繼承人織田信忠聞訊立刻退進二條御所，和村井貞勝組織抵抗。信忠給明智軍造成了很大的麻煩，但也因為寡不敵眾而被迫自殺，村井貞勝父子也一并殉難。

對于這場改變?nèi)毡臼返恼?，歷來猜測頗多，有人認為，朝廷曾經(jīng)請信長在太政大臣、關(guān)白和大將軍三個職務(wù)中挑選一個，但信長拒絕了。疑慮重重的朝廷摸不清信長的意圖，認為他可能有篡位的企望，于是暗中指派光秀發(fā)動了本能寺之變。也有人把這個屎盆子扣到了本能寺之變以后行蹤詭異的羽柴秀吉和德川家康頭上。羽柴秀吉在事變前把信長請了出來，直接導(dǎo)致事變的結(jié)局，在事變后又以匪夷所思的速度回到京都，所以就有人認為秀吉早知道事變的結(jié)果，才會有這樣的舉動；后者則在事變后繞路逃回三河，很快搶了織田的地盤，讓人對他所扮演的角色頗多懷疑。當然，還有人認為幕后黑手是千利休、織田家臣團等等。人人都提出自己的觀點，然而，事變的主人公明智光秀卻在事變以后不到半個月內(nèi)就下落不明，本能寺之變的背后故事，也只能付之闕如了。

筆者云：信長蓋世英雄，于日本近世之軍制、政制、兵法、經(jīng)濟等多有所創(chuàng)見。其于領(lǐng)地之中，推行“樂市樂坐”，取消通行稅，鼓勵商業(yè)，亦于西方文明多有引進。日本經(jīng)戰(zhàn)國之亂。得有信長將亂世之成果總結(jié)發(fā)揚，后經(jīng)豐臣、德川，遂定日本近世之基礎(chǔ)。信長實為日本統(tǒng)一之奠基人物，影響之大，為同時期之人所不及。