有意思的是，滿清朝廷為此專門傳諭天下：“如果有人報告真太子的行跡，朝廷必加恩養(yǎng)。報告之人必給重賞?！笨僧?dāng)滿清鎮(zhèn)壓了各地的明朝殘余，坐穩(wěn)江山后，將原先“恩養(yǎng)”在北京的十幾個明朝藩王全部殘殺。清朝對明朝皇室進(jìn)行了“大清洗”，也就沒有人相信朝廷所謂“恩養(yǎng)太子”的承諾了。

就是北京冒出一個太子的同時，南方明朝殘余勢力擁戴福王朱由淞建立的南明王朝也出了一個“太子案”。有一個年輕人在東南一帶自稱是南逃的太子朱慈烺。接到消息后，南明政權(quán)面臨的第一個問題也是“辨認(rèn)真?zhèn)巍?。朱由淞接到報告，派曾在紫禁城?dāng)過差的太監(jiān)李繼周去迎接朱慈烺。李繼周覺得朱慈烺很眼熟，氣度不凡，就跪下叩頭：“奴才給小爺叩頭。”朱慈烺問他：“我雖認(rèn)得你，但忘了姓名。”李繼周忙報上姓名和來意，要迎接朱慈烺去南京。朱慈烺再問：“迎我進(jìn)京，讓皇帝與我做否？”李繼周實話實說：“此事哪是我等奴才所能知曉的！”1645年3月2日，朱由淞面諭群臣說：“有一稚子自稱是先帝太子。如果真的是先帝之子，那么也是朕之子，定當(dāng)撫養(yǎng)優(yōu)恤，不能讓他受委屈了?！弊⒁?，朱由淞一開始就給整個“太子案”定了基調(diào)。首先，這個朱慈烺“自稱”是太子，真假莫辨；其次，即使這個朱慈烺是真太子，那也不能當(dāng)皇帝。南明朝廷會好好養(yǎng)著他。朱由淞接著派了南下的兩個太監(jiān)先去辨別真?zhèn)?。兩個太監(jiān)一見朱慈烺，立即上去抱住痛哭。他們看到朱慈烺衣服單薄，還脫下自己的衣服給他披上。朱由淞知道后，下令將這兩個太監(jiān)打死，同時賜李繼周“自盡”?？赡暇├习傩掌毡檎J(rèn)為這是真太子，紛紛要求太子登基稱帝。

朱由淞當(dāng)然不愿意讓出皇位了，采取了“拖延”戰(zhàn)術(shù)，開始了冗長的真?zhèn)伪嬲J(rèn)過程。南明官員們紛紛前往探視朱慈烺，或遞送名帖。但對于太子的真?zhèn)?，大家莫衷一是。朱由淞怕夜長夢多，下令將朱慈烺移到宮中嚴(yán)加看管。他再召集元勛顯貴和大學(xué)士馬士英等人商量如何了結(jié)此事。馬士英迎合朱由淞的意思，當(dāng)即認(rèn)為朱慈烺是假太子，還提出了三個疑點：一，太子逃離北京后為什么不來陪都南京，反而在杭州蘇州一帶游蕩；二，聽聞太子嚴(yán)肅凝重，不善言語，但此人善于機辯；三，北京的滿清朝廷也正在審理“太子案”，還不知道真?zhèn)?。馬士英極力主張南京的朱慈烺是假的，進(jìn)一步建議弘光帝詢問朱慈烺永、定二王的生辰及宮中制度，同時找出曾教過太子的方拱乾、李景濂、劉正宗等人前去“會審”。最后的審問開始后，這個朱慈烺對著紫禁城地圖，一一指出了各宮由何人居住。一個官員突然問：“公主現(xiàn)在在哪里？”朱慈烺回答：“不知道，想必死了吧?！狈焦扒⒗罹板?、劉正宗出現(xiàn)后，朱慈烺只認(rèn)識方拱乾。方拱乾就問他當(dāng)年講課的場所，授課的內(nèi)容。結(jié)果朱慈烺都答錯了。又有官員問朱慈烺嘉定伯（周奎）的姓名，朱慈烺拒絕回答。最后，大學(xué)士王鐸認(rèn)為眼前的朱慈烺是假冒的，得到了眾人的附和。在場的通政司楊維垣出面指認(rèn)眼前的朱慈烺是已故駙馬都尉王昺的侄孫王之明。于是眾人以奸人假冒太子結(jié)案。朝廷隨即布告天下，“以正視聽”。

南明太子案的審理同樣疑點重重，結(jié)案后引起各地官員和百姓一片嘩然。南明王朝本來根基就不穩(wěn)，地方藩鎮(zhèn)將領(lǐng)手握重兵，對朝廷虎視眈眈?，F(xiàn)在太子被判定為假太子，早對馬士英不滿的武漢藩鎮(zhèn)左良玉稱奉太子密詔率部救難，進(jìn)攻南京，要殺馬士英。南明朝廷亂成了一團。清軍大舉南下，五月十日弘光帝出逃。十一日，南京百姓數(shù)百人砸開監(jiān)獄，救出朱慈烺，給他披上演戲用的龍袍，擁他做皇帝。這個朱慈烺還真的進(jìn)入皇宮做起了皇帝，接受臣民的朝賀，還向南京內(nèi)外發(fā)號施令，很有那么回事?？上辉趤y哄哄中做了五天皇帝，就被攻入南京的清軍抓住了。不久，逃亡的朱由淞也被抓住，押回南京與朱慈烺“團聚”，兩人一起在北京被處死。