9 月27 日，倉央嘉措一行來到了當(dāng)年五世達(dá)賴?yán)锞幼∵^的聶塘扎西崗。這時，丹增達(dá)賴汗、第巴桑結(jié)嘉措等率領(lǐng)蒙、藏僧俗官員及三大寺代表1000 多人前來迎接。他們向倉央嘉措敬獻(xiàn)了哈達(dá)、無量壽佛像、長壽經(jīng)咒、殊勝塔等禮品。

28 日，倉央嘉措再次與五世班禪會面，并共同在聶塘扎西崗居住近一個月，除誦經(jīng)、講經(jīng)、摩頂?shù)确ㄊ禄顒油?，還同第巴桑結(jié)嘉措等共同商定了前往拉薩的路線、時間及坐床儀式等事宜。

10 月24 日，迎請靈童的馬隊繼續(xù)前進(jìn)。中午時分，康熙帝的使臣章嘉呼圖克圖及扎薩克喇嘛等帶領(lǐng)百余人前來迎接，同時趕到的還有哲蚌寺的儀仗隊。當(dāng)天，大隊人馬夜宿姜塘崗的吉賽魯定。

1697 年10 月25 日，由第巴桑結(jié)嘉措引香帶路，即將年滿15 歲的倉央嘉措被迎至布達(dá)拉宮噶當(dāng)姆其寢宮內(nèi)少憩后，來到布達(dá)拉宮司西平措大殿。經(jīng)過消災(zāi)、驅(qū)邪、沐浴等儀軌后，登上無畏寶座，舉行了隆重的坐床典禮。

典禮之后，扎什倫布寺的總管洛桑貢布代表五世班禪敬獻(xiàn)了珍奇寶物、綾羅綢緞等大量賀禮。章嘉呼圖克圖呈獻(xiàn)了皇帝封誥、賀禮和敕書，并授予封文，正式認(rèn)定倉央嘉措為第六世達(dá)賴?yán)铩?/p>

西藏三大寺的住持、活佛、各級僧俗官員、民眾代表及青海蒙古代表等參加了慶典，敬獻(xiàn)賀禮。這天下午，在德央廈廣場上，舉行了跳神和歌舞活動。晚上，為紀(jì)念當(dāng)天宗喀巴大師忌辰，已成為六世達(dá)賴的倉央嘉措到布達(dá)拉宮神殿朝圣，并在自在觀世音佛像前同僧眾一起進(jìn)行了禱告。

30 日，五世班禪從扎什倫布寺來到拉薩，在布達(dá)拉宮傳授佛法，并講述五世達(dá)賴?yán)锏纳郊捌錇槲鞑胤鸾毯捅娚男腋Ｋ鞒龅木薮筘暙I(xiàn)，鼓勵倉央嘉措效法前世，勤奮學(xué)習(xí)經(jīng)典，弘傳佛法。五世班禪的授課，也拉開了倉央嘉措在桑結(jié)嘉措的監(jiān)督下繼續(xù)更嚴(yán)格的佛法研習(xí)的序幕。

根據(jù)歷史文獻(xiàn)記載，倉央嘉措的經(jīng)師主要有五世班禪羅桑益西、甘丹寺大法座卓尼· 楚臣達(dá)杰、格隆嘉木洋查巴、阿里格列嘉措、德東日甸林巴等人。據(jù)《倉央嘉措傳》中引述倉央嘉措自己的回憶，第巴桑結(jié)嘉措對他的學(xué)習(xí)要求十分嚴(yán)格，倉央嘉措有時厭學(xué)而去散步，經(jīng)師們都尾隨在后，反復(fù)懇求他坐下聽經(jīng)， 唯恐第巴追究責(zé)任。

倉央嘉措相繼學(xué)習(xí)了眾多佛教經(jīng)典，如《根本咒》、《秘訣》、《供咒經(jīng)》、《續(xù)說》、《生滿誡》、《菩提道廣略教誡》等。為了培養(yǎng)倉央嘉措，第巴桑結(jié)嘉措還親自講授了梵文音韻知識。桑結(jié)嘉措本人十分博學(xué)，精通五明醫(yī)藥及歷算、建筑等，著述頗多。據(jù)說卷帙浩繁的《甘珠爾》倉央嘉措先后學(xué)過三遍，第一遍就是由桑結(jié)嘉措親自講授的。

坐床兩年之后，第巴桑結(jié)嘉措又指名幾位著名格西（藏傳佛教高階學(xué)位，相當(dāng)于博士）擔(dān)任侍讀，指導(dǎo)倉央嘉措系統(tǒng)學(xué)習(xí)佛教因明學(xué)、詩學(xué)和歷算等典籍。所學(xué)內(nèi)容不分派別，諸如薩迦、格魯、寧瑪?shù)雀鞣N有成就的經(jīng)藏、密咒、教規(guī)等無所不學(xué)，并輪流到拉薩三大寺等地講經(jīng)說法。