1950年3月1日，已逃往臺(tái)灣剛喘過(guò)一口氣的蔣介石，在“國(guó)大代表”及各界人士“勸進(jìn)”下，一腳踢開(kāi)以治病為名滯留美國(guó)，怕遭到像張學(xué)良一樣軟禁待遇而不敢回臺(tái)的李宗仁（南按：桂系軍隊(duì)幾乎全軍覆滅，李已失去依靠），在臺(tái)北“總統(tǒng)府”正式“復(fù)職視事”，履行“總統(tǒng)職權(quán)”。從此偏安一隅，成為終身“總統(tǒng)”，且把其位傳諸其子蔣經(jīng)國(guó)。蔣介石在臺(tái)灣“登基”后，遠(yuǎn)在美國(guó)紐約、不明事理的李宗仁聞?dòng)?，?duì)外發(fā)表講話，稱(chēng)自己仍是中華民國(guó)的“代總統(tǒng)”，正準(zhǔn)備回國(guó)復(fù)職，想不到蔣氏竟違背憲法，嬗自宣布令人驚異云云。蔣介石見(jiàn)報(bào)，立即實(shí)施反制，公開(kāi)致電李宗仁，以“總統(tǒng)”身份令其“代表中正訪問(wèn)美國(guó)朝野從速回國(guó)”。李宗仁搞了個(gè)灰頭土臉，四年后終于被蔣介石以憲法的名義，正式罷免早就已經(jīng)被國(guó)人拋入九霄云外的所謂“副總統(tǒng)”職位。在美國(guó)的李宗仁聞?dòng)嵍迥_罵娘，但已沒(méi)有多少人有興趣聽(tīng)這個(gè)敗軍失國(guó)之將和不成器的官僚政客瞎吵嚷了。

同不識(shí)大體的李宗仁相比，老奸巨猾的閻錫山聰明乖巧得多。蔣介石復(fù)職后，閻深感不妙，主動(dòng)向蔣介石辭去“行政院長(zhǎng)”（南按：1950年1月—1950年3月，由顧祝同接替閻出任“國(guó)防部長(zhǎng)”），蔣虛意挽留，終獲準(zhǔn)許，由陳誠(chéng)繼任“行政院長(zhǎng)”。從此，臺(tái)灣的蔣氏政權(quán)開(kāi)始形成了“蔣陳體制”，陳誠(chéng)一躍成為臺(tái)灣僅次于蔣氏的二號(hào)實(shí)權(quán)人物。閻錫山辭職后，獲得“總統(tǒng)府”資政和國(guó)民黨中央評(píng)議委員兩個(gè)虛銜，而后一頭鉆入臺(tái)北市金山之麓自己蓋的窯洞中，不問(wèn)世事，埋頭著述，過(guò)起了隱士生活。

與閻錫山在廣州一道組閣并出任行政院副院長(zhǎng)的朱家驊，自國(guó)民政府一幫孤臣敗將遷臺(tái)后，“總統(tǒng)府”與“行政院”均在臺(tái)北介壽館辦公。因 “代總統(tǒng)”李宗仁仍在美國(guó)，不能抵臺(tái)視事，自1950年2月19日起，由朱家驊代行“總統(tǒng)”職權(quán)，此為朱氏一生權(quán)力達(dá)到巔峰的短暫時(shí)刻。據(jù)李宗仁回憶說(shuō)：“朱家驊在當(dāng)時(shí)黨人中算是比較識(shí)大體的一位……為著維持‘銀元券’，他曾兩度飛臺(tái)，向蔣請(qǐng)示，擬運(yùn)一批銀元來(lái)穗。此舉可說(shuō)純?yōu)榇缶种?，遠(yuǎn)非陳果夫、陳立夫兄弟所能及。然朱家驊可能因此而觸蔣氏之忌，嗣后在臺(tái)幾度遭蔣的為難。”[42]李宗仁所言大體不差，蔣介石早就把朱視為異己分子而有收拾之心。蔣復(fù)任“總統(tǒng)”后，深知一朝天子一朝臣的朱家驊同閻錫山一樣，頗有自知之明地辭卻“行政院”副院長(zhǎng)之職，專(zhuān)任“總統(tǒng)府”資政與“中央研究院”代院長(zhǎng)，以避鋒芒。但是，蔣介石并沒(méi)有忘記在自己最倒霉的時(shí)候，朱氏所做的落井下石的前朝舊事，總是耿耿于懷，待機(jī)而發(fā)。

1950年6月，朝鮮戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)，美國(guó)第七艦隊(duì)駛?cè)肱_(tái)灣海峽阻止解放軍進(jìn)攻，岌岌可危的國(guó)民黨小朝廷穩(wěn)住了陣腳。在這種急轉(zhuǎn)直下的局面下，一直忍而不發(fā)的蔣介石開(kāi)始對(duì)前朝的“叛逆”予以外科手術(shù)式打擊和肅清。當(dāng)王世杰的“總統(tǒng)府”秘書(shū)長(zhǎng)被以“蒙混舞弊，不盡職守”罪名整肅掉之后（南按：有人說(shuō)王在蔣面前說(shuō)了一句“我是鞠躬盡瘁，死而后已”，惹得蔣大怒，意即王氏把蔣氏父子看成阿斗之類(lèi)的人物，王遂被撤職），便把目標(biāo)轉(zhuǎn)向了朱家驊。此時(shí)的朱家驊與炙手可熱、大權(quán)在握的陳誠(chéng)關(guān)系越來(lái)越糟，遂加快了其被從國(guó)民黨權(quán)力圈中掃地出門(mén)的步伐。在各方權(quán)貴陰謀與陽(yáng)謀的合力夾擊、施壓下，朱家驊心有不甘但又無(wú)可奈何地于1957年10月22日辭去“中央研究院”代院長(zhǎng)一職，1958年1月11日辦理移交手續(xù)，只剩一個(gè)新聘的“總統(tǒng)府國(guó)策顧問(wèn)”空冠戴回家中高掛于墻壁之上，以發(fā)思古之幽情，嘆世事之無(wú)常了。

朱氏辭職后，蔣屬意胡適回臺(tái)繼任，在胡一時(shí)不能回歸之前，指令由李濟(jì)暫代“中央研究院”院長(zhǎng)職。未久，“中央研究院”按照慣例召開(kāi)評(píng)議會(huì)推選新任院長(zhǎng)，眾評(píng)議員推舉了三人，即胡適、李濟(jì)、李書(shū)華，由“總統(tǒng)”圈點(diǎn)，胡適當(dāng)然地進(jìn)入圈內(nèi)。據(jù)石璋如說(shuō)：“做過(guò)駐美大使、北大校長(zhǎng)的胡適先生，抗戰(zhàn)中幫了中國(guó)不少忙，政治上堅(jiān)決反共，（民國(guó)）四十幾年大陸清算胡先生，臺(tái)灣眼見(jiàn)大陸批胡，于是就捧胡，使臺(tái)灣與胡先生合拍。若非大陸清算胡先生，以他的自由派立場(chǎng)，總統(tǒng)也不太放心的。當(dāng)局既然有心按排胡先生出任中央研究院院長(zhǎng)，自然就要虛位以待，朱先生必須辭職。”[43]

石氏的回憶再次印證，蔣介石早就想收拾朱家驊，只是沒(méi)有一個(gè)適當(dāng)?shù)慕杩诙t遲未能得手，恰好這時(shí)胡適提出回臺(tái)蓋房著書(shū)立說(shuō)，蔣氏決意要拿自己的稿費(fèi)予以成全，看似違反常規(guī)，實(shí)則是一個(gè)倒朱扶胡的信號(hào)。這個(gè)信號(hào)朱家驊或許蒙在鼓里，或許已有警覺(jué)，但不管哪一種情形，到了這個(gè)時(shí)候已經(jīng)顯得不重要了，重要的是朱在什么時(shí)間下臺(tái)的問(wèn)題。當(dāng)蔣介石等得不耐煩的時(shí)候，便抓住“中央研究院”人員“偷懶”這個(gè)不是問(wèn)題的問(wèn)題向朱開(kāi)火。朱氏不堪重?fù)?，轟然倒地，而中共在大陸發(fā)起的“批胡運(yùn)動(dòng)”，又促使蔣做出反擊的姿態(tài)并有明確的表示。如此這般，胡適像當(dāng)年水泊梁山的及時(shí)雨宋江一樣，順利坐上了已落草臺(tái)灣孤島的“中央研究院”院長(zhǎng)頭把虎皮交椅。正可謂“時(shí)來(lái)天地皆助力，運(yùn)去英雄不自由”，如此陰陽(yáng)差錯(cuò)的命運(yùn)交織，是朱家驊和胡適本人都始料不及的。