當天下午，近衛(wèi)召集夫人千代子、次子通隆、弟弟秀麿，舉行了一次家庭會議，對他入獄后家中的事務做了安排。隨后，他與家人及前來拜訪的朋友作家山本有三、后藤隆之助、前任內閣秘書長富田健三等人共進晚餐。席間，他仍談笑自若，未流露絲毫沮喪的情緒。

晚飯后，近衛(wèi)送走了客人，便走進書房，很久沒有露面。他的家人和秘書已熟知他的習慣，他走進書房后，討厭任何人打攪。他們還以為他正在處理善后事宜，或是在寫作。

16日凌晨1時，人們都已入睡，宅邸內寂靜無聲。就在這時，近衛(wèi)走出書房，來到夫人的臥室，打開電燈，把夫人叫醒，要她把兒子叫來。

“這么晚了，叫他有什么事？”夫人疑惑地問。

“你叫他來一下，我有話吩咐?！苯l(wèi)說。

當千代子喊來兒子時，近衛(wèi)已在化妝臺上擺好了紙筆。他表情嚴肅地對兒子說：

“你坐下，記錄我的話?！?

千代子這時才感到近衛(wèi)有些反常。她神情凄楚地坐在床上，想聽聽丈夫要說些什么。

近衛(wèi)開始了他一生中最后的講話：

“我最感到惶恐不安的是，自中日事變發(fā)生后，由我所處理的政務之中，曾釀成若干錯誤。然而我不能忍受被捕及身受美國法庭審訊之恥辱。我尤覺對中日戰(zhàn)爭須負責任……”

1時40分左右，近衛(wèi)口述完他的遺書后，回到自己的臥室，立即吞下了事先準備好的劇毒藥丸。

清晨6時左右，千代子起床后，發(fā)現(xiàn)丈夫臥室內仍有燈光，覺得異常，連忙推門進去，見近衛(wèi)躺在床上，已經死去。

盟軍總司令部聞訊后，立即派軍醫(yī)和憲兵趕到近衛(wèi)的宅邸。陸軍攝影記者拍下了近衛(wèi)死后的鏡頭。目擊者見近衛(wèi)緊閉的雙眼呈紫黑色，臉上留著死前掙扎的痛苦表情。近衛(wèi)的兒子坐在沙發(fā)上，既不哭泣，也不講話，僅向美國憲兵交出了近衛(wèi)的口述、由他記錄的遺書。

近衛(wèi)文麿服毒自殺后，日本某報曾發(fā)表評論，指責他懦弱膽小，竟怕剖腹太痛苦，而選擇服毒這種窩窩囊囊的死法，丟了日本武士的“面子”。