劉少奇對(duì)他認(rèn)為比較好的工作組，也就是能夠有效地對(duì)運(yùn)動(dòng)實(shí)施領(lǐng)導(dǎo)的工作組，是堅(jiān)決支持的。在他看來，這么大的群眾運(yùn)動(dòng)沒有黨的領(lǐng)導(dǎo)是不可想象的，既然那些學(xué)校的領(lǐng)導(dǎo)癱瘓了，那就只有派工作組去接替，以維持正常的秩序。

6月18日，北京大學(xué)發(fā)生一起亂打亂斗事件。上午9時(shí)至11時(shí)，北京大學(xué)幾個(gè)系的一些學(xué)生，將40多位干部、教師拉出來批斗，并采取了臉上抹黑、戴高帽子、罰跪等行動(dòng)。工作組發(fā)覺后迅速予以制止，扭轉(zhuǎn)了局勢(shì)。劉少奇對(duì)駐北大工作組的做法表示滿意。6月20日，他將駐北大工作組關(guān)于反映這次事件處理情況的《北京大學(xué)文化革命簡(jiǎn)報(bào)（第九號(hào)）》轉(zhuǎn)發(fā)全國(guó)。劉少奇在為中共中央起草的批語(yǔ)中說：“中央認(rèn)為北大工作組處理亂斗現(xiàn)象的辦法，是正確的，及時(shí)的。各單位如果發(fā)生這種現(xiàn)象，都可參照北大的辦法處理?！?/p>

為便于及時(shí)了解情況，掌握局面，6月19日劉少奇要夫人王光美去清華大學(xué)，作為駐清華大學(xué)工作組的顧問，幫助指導(dǎo)運(yùn)動(dòng)。6月20日和7月11日，他兩次召集駐北京師范大學(xué)附中的工作組匯報(bào)座談，同他們一起分析運(yùn)動(dòng)中出現(xiàn)的各種情況，解決問題。

6月21日，劉少奇在他主持的政治局常委擴(kuò)大會(huì)上提出：“這一場(chǎng)斗爭(zhēng)咱們都沒有經(jīng)驗(yàn)，工作組也沒有經(jīng)驗(yàn)?！薄坝械膶W(xué)校趕工作組，向工作組奪權(quán)，要奪檔案、槍支、廣播這些權(quán)。不準(zhǔn)隨便提出奪權(quán)?！薄皧Z權(quán)斗爭(zhēng)，有的是壞人要我們撤走工作組。不好的工作組也可以撤走，但是不要黨的領(lǐng)導(dǎo)、中斷黨的領(lǐng)導(dǎo)是不好的?！?/p>

6月30日，劉少奇、鄧小平致信毛澤東，要求發(fā)出《關(guān)于工業(yè)交通企業(yè)和基本建設(shè)單位如何開展文化大革命運(yùn)動(dòng)的通知》。《通知》強(qiáng)調(diào)這些單位的運(yùn)動(dòng)要由工作隊(duì)領(lǐng)導(dǎo)：正在進(jìn)行“四清”的單位，要在工作隊(duì)領(lǐng)導(dǎo)下，把文化大革命插進(jìn)去進(jìn)行；還沒有進(jìn)行“四清”的單位，由上級(jí)派出工作隊(duì)領(lǐng)導(dǎo)進(jìn)行；已經(jīng)結(jié)束“四清”而又沒有達(dá)到標(biāo)準(zhǔn)，要重新派工作隊(duì)去，從文化大革命入手，把“四清”和文化大革命搞徹底。這一通知于7月2日經(jīng)毛澤東批準(zhǔn)后下發(fā)。

大約在6月20日以后，劉少奇、鄧小平等中央領(lǐng)導(dǎo)同志同“中央文革小組”之間在工作組問題上的分歧明顯加劇，社會(huì)上趕工作組的現(xiàn)象也增多了。

6月20日，“中央文革小組”向中央提出了一個(gè)書面建議，其中說：“建議全國(guó)大中學(xué)校、機(jī)關(guān)單位在適當(dāng)時(shí)候成立文化革命小組，領(lǐng)導(dǎo)文化革命運(yùn)動(dòng)。”“在最必要的地方，最必要的時(shí)候，可以由上級(jí)派工作組。”這一建議曲折間接地表達(dá)了他們?nèi)∠ぷ鹘M的意見。

7月13日、19日、22日，陳伯達(dá)在參加政治局常委召集的匯報(bào)會(huì)上，三次對(duì)工作組的問題提出非議。但據(jù)現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)的資料，陳伯達(dá)在發(fā)表意見時(shí)，態(tài)度不大鮮明。例如他在7月19日的會(huì)上只是說：“工作組不會(huì)比學(xué)生高明，工作組都自稱是黨中央、毛主席派去的，有的整學(xué)生?！?/p>

在這幾次會(huì)上，劉少奇、鄧小平也對(duì)工作組有所批評(píng)，但不同意馬上就撤出工作組。在7月13日的會(huì)上，劉少奇說：“現(xiàn)在的工作隊(duì)要進(jìn)行教育，他們不懂政策，不學(xué)政策。不好的工作隊(duì)要進(jìn)行整頓清理?！编囆∑秸f：“要先把學(xué)生組織起來，清理當(dāng)權(quán)派，然后再撤銷工作組、工作隊(duì)?！痹?月19日的會(huì)上，劉少奇說：“工作組有好的，有壞的，他們?cè)诘谝痪€，有他的辛苦，要求不能過高?，F(xiàn)在是如何幫助他們，教育他們，總結(jié)工作經(jīng)驗(yàn)?！编囆∑秸f：“有的機(jī)關(guān)和學(xué)校，不派工作組可以，有的要奪權(quán)的，就要派工作組。工作組主要是起行政和黨委的領(lǐng)導(dǎo)作用，因此是否統(tǒng)盤考慮，對(duì)工作組要正確估計(jì)。我們對(duì)這樣的運(yùn)動(dòng)沒有經(jīng)驗(yàn)，他們也沒有經(jīng)驗(yàn)。壞的工作組可以先撤，好的工作組可以留，代替黨委工作?！痹?月22日的會(huì)上，劉少奇說：“工作組領(lǐng)導(dǎo)不好，但是多數(shù)工作組是好的，還是教育幫助，改正錯(cuò)誤。趕工作組，有的不應(yīng)該趕?！编囆∑秸f：“要教會(huì)工作隊(duì)做工作。……有的學(xué)校沒有工作隊(duì)恐怕不行。”

參加這幾次會(huì)議的大多數(shù)同志都不同意撤工作組，陳伯達(dá)的意見被否決。后來江青在中共八屆十一中全會(huì)的一次小組發(fā)言中講到：“22號(hào)晚上，胡克實(shí)同志匯報(bào)說已經(jīng)走上正規(guī)了。這次匯報(bào)會(huì)雪峰同志參加了，我們的組長(zhǎng)、顧問沒有發(fā)言權(quán)，講一句話就被打斷。這次匯報(bào)會(huì)共用了五個(gè)多小時(shí)，薄一波、陶魯笳卻講了三個(gè)多小時(shí)?！苯嗨f的：“我們的組長(zhǎng)、顧問”即指陳伯達(dá)、康生。她的說法從反面印證了當(dāng)時(shí)中央大多數(shù)領(lǐng)導(dǎo)同志對(duì)“中央文革小組”意見的批評(píng)和抵制。

對(duì)陳伯達(dá)關(guān)于工作組的意見被否決的情況，劉少奇8月1日在中共八屆十一中全會(huì)上從自我批評(píng)的角度，作了這樣的解釋：“陳伯達(dá)同志早就提了不派工作組或者撤出工作組，提了三次。……第一次提出來沒有多討論。第二次陳伯達(dá)書面提出兩條，討論時(shí)多數(shù)同志還是要工作組，我也發(fā)言要工作組，認(rèn)為工作組有方便之處，要去就去，要撤就撤。當(dāng)時(shí)我曾考慮，這樣大的運(yùn)動(dòng)，北京各院校部分組織已經(jīng)癱瘓了，怕中斷了黨的領(lǐng)導(dǎo)不好。第三次，伯達(dá)同志又提出這個(gè)問題，又討論了一次，多數(shù)同志還是不主張撤。我仍是以前的觀點(diǎn)，我認(rèn)為這一方法較機(jī)動(dòng)，沒有下決心撤，要看一看。同時(shí)，主席快回來了，回來再請(qǐng)示決定。主席回來的第二天，又開了個(gè)會(huì)，感到是個(gè)問題?！?