朱厚熜在登基之初，一個(gè)重要的詔令，就是廣開言路，鼓勵(lì)言官大膽進(jìn)言，并為朱厚照時(shí)代獲罪的言官平反冤案。但在他大多數(shù)執(zhí)政時(shí)間里，對(duì)于言論，卻多采取壓制方式。他壓制的方式，就是“杖責(zé)”。他杖責(zé)的方式，是非?！傲憔嚯x”的。比如嘉靖四年（1525），云南御史郭楠上奏，要求撫恤“大禮儀”之爭(zhēng)中的獲罪官員家屬，朱厚熜立刻下令，命令錦衣衛(wèi)帶著大棍，乘快馬八百里加急，就為了到萬里之外的云南打郭楠二十大板。嘉靖十三年（1534），戶部給事中張選要求朱厚熜親自拜祭孔子，惱怒的朱厚熜不但杖責(zé)張選，甚至還特意跑到牢房隔壁，親自聽毆打張選的棍子聲。嘉靖十九年（1540），朱厚熜想閉關(guān)煉丹，太仆寺卿楊最上奏說：“臣就是被陛下打死，也要上奏勸阻陛下。”朱厚熜看完后立刻說：“那就把他打死吧！”結(jié)果，楊最被活活打斷了氣。

狹隘猜忌的朱厚熜，對(duì)大臣的不信任，幾乎到了極其苛刻的地步，甚至一點(diǎn)兒芝麻大的小事，都有可能招禍。朱厚熜對(duì)待大臣，表面上很親切，經(jīng)常拉著大臣拉家常，甚至討論學(xué)問，但就在溫情脈脈間，可能稍微不注意，就會(huì)招得他當(dāng)場(chǎng)翻臉。嘉靖二十五年（1545），朱厚熜一次召內(nèi)閣首輔嚴(yán)嵩和吏部尚書熊俠，說要一起對(duì)對(duì)子，他出了個(gè)上聯(lián)叫“閣老心高高似閣”。就這一句，嚇得嚴(yán)嵩當(dāng)場(chǎng)“撲通”跪倒，搗蒜般地磕頭，渾身冷汗直冒。朱厚熜接著冷冷地說：“你要是對(duì)不出來，我這里倒有一個(gè)下聯(lián)--天官膽大大如天?！痹捯粑绰?，旁邊的熊俠也緊跟著“撲通”跪下，連磕頭的勁兒都沒了，渾身哆嗦得如篩糠。這個(gè)對(duì)聯(lián)連起來的意思就是：做內(nèi)閣首輔的嚴(yán)嵩，心氣太高了，高得內(nèi)閣首輔這個(gè)官都容不下他了。做吏部尚書的熊俠，膽子也太大了。大的都要比過天了--你們倆以后都給我老實(shí)點(diǎn)！

盡管朝野爭(zhēng)斗不斷，但在朱厚熜執(zhí)政的前二十年，除了大禮儀之爭(zhēng)外，在國事上也同樣作了許多努力。主要包括整頓吏治、提高政府效率以及改革賦稅征收方式。從朱厚熜登基開始，明王朝在政府管理上就有了嚴(yán)格規(guī)定，每天散朝后，各級(jí)官員必須立刻回衙門辦公，并有嚴(yán)格的考勤制度。而賦稅的改革，則改變了以往明朝稅收征收名目繁多的弊端，從嘉靖九年（1530）開始，明王朝將原本分散征收的稅收項(xiàng)目，折合成秋糧統(tǒng)一征收，從此化繁為簡(jiǎn)。這兩項(xiàng)改革，不但在當(dāng)時(shí)收到了成效，在后來的萬歷朝，更演變成張居正改革的兩項(xiàng)核心內(nèi)容--考成法與一條鞭法。