抗戰(zhàn)進(jìn)入相持階段以后，針對(duì)國民黨蔣介石的反共活動(dòng)，章伯鈞更是公開站出來反對(duì)，強(qiáng)調(diào)：“在當(dāng)前抗戰(zhàn)戰(zhàn)線上，共產(chǎn)黨是同樣效忠國家，為民族服役，參加抗戰(zhàn)，更無特殊標(biāo)榜反共的理由?！碧貏e是章伯鈞領(lǐng)導(dǎo)的第三黨，有著長期反對(duì)國民黨蔣介石專制獨(dú)裁統(tǒng)治的歷史，又與中共關(guān)系十分密切，這引起了國民黨蔣介石的強(qiáng)烈不滿，千方百計(jì)地想瓦解和消滅第三黨。

為此，陳誠奉蔣介石之命，專門找章伯鈞談話，要求取消第三黨，將其成員并入三民主義青年團(tuán)，但遭到婉言拒絕。隨后，蔣介石又派陳立夫再三用封官許愿的方式去拉攏收買章伯鈞，希望章伯鈞把第三黨解散了，請他參加政府，隨意擔(dān)任哪一個(gè)部部長，蔣介石都可以考慮。章伯鈞提出，只有中共參加政府才能解決問題，明確拒絕單獨(dú)參加政府。

后來，在蔣介石的分化瓦解下，第三黨內(nèi)部有人提出“在國共之間采取超然態(tài)度，持絕對(duì)中立”的主張。章伯鈞認(rèn)為，一個(gè)黨派“政治上沒有什么中立，總是要偏向某一方面的。比如青年黨，他們就偏向國民黨，我們不能這么辦。我們是代表工農(nóng)平民的政黨，應(yīng)該偏向共產(chǎn)黨”。

章伯鈞堅(jiān)決頂住來自黨內(nèi)外的巨大壓力，堅(jiān)持與中共合作的立場進(jìn)一步密切了兩黨的關(guān)系。對(duì)此，周恩來曾向中共中央?yún)R報(bào)說：“第三黨近因當(dāng)局之壓迫，日漸左傾，現(xiàn)正整頓其組織，并提出聯(lián)蘇聯(lián)共之中心主張，與我們建立密切之合作。該黨凡在大是大非的斗爭中，都站在共產(chǎn)黨一邊，采取了積極的態(tài)度?！?

為了聯(lián)合起來，共同對(duì)付國民黨的壓迫，1939年11月，章伯鈞與各民主黨派領(lǐng)導(dǎo)人和無黨派民主人士張瀾、沈鈞儒、黃炎培、梁漱溟、羅隆基、左舜生等人經(jīng)過積極聯(lián)絡(luò)和籌備，在重慶成立了一個(gè)國共兩黨以外的“第三者”性質(zhì)的政治組織——“統(tǒng)一建國同志會(huì)”，章伯鈞當(dāng)選為常務(wù)干事。