黃興發(fā)電駁斥莊電后，上?！渡陥蟆犯浴度幤窞轭}發(fā)表長篇社論，其中稱贊莊、孫二都督“謀國之忠”，同時又攻擊孫中山等人“陽托參議院之議決，而陰以遂其脅制之私，置滿蒙回藏于不顧”。

風(fēng)頭正健的章太炎更是抓住機(jī)會大唱反調(diào)，他宣稱南京地處偏倚，備有“五害”：一是威力不能及于長城外；二是北民化為蒙古；三是日本、俄國侵及東三省，中原如失重鎮(zhèn)，必有土崩瓦解之憂；四是清帝、宗社黨、蒙古諸王可能作亂，致使國家分裂；五是遷都耗費(fèi)巨資，難以籌劃。在論證了南京不能為“首善之居”后，章太炎含譏帶諷地說：謀國事者，當(dāng)規(guī)度利弊，顧瞻全勢，而不可以意氣爭也。

宋教仁與孫、黃等人的看法也不盡相同。宋曾于1907年親入關(guān)外聯(lián)系東北馬匪革命，深知日、俄窺我萬里北疆已非一日，而此時俄、日正積極推動滿蒙獨(dú)立。從國防外交及東北邊疆的戰(zhàn)略地位考量，定都南京鞭長莫及，實(shí)非上策。

在輿論的煽動下，各省都督、紳商代表也紛紛致電南京臨時政府，對定都南京大表異議。就連一貫主張建都武昌的黎元洪，這時也改口支持定都北京，“以免釀成大患”。

反對聲浪中，革命陣營也有湘桂聯(lián)軍發(fā)電反駁，但南京軍界中的一些重要將領(lǐng)如浙軍司令朱瑞、粵軍司令姚雨平、第一軍團(tuán)長柏文蔚、光復(fù)軍司令李燮和等人以更大的聲音發(fā)表聯(lián)名通電，主張臨時政府建都北京為妥。

中國之所謂“南北”，大體以江淮為界，南北雙方人民固然有風(fēng)俗、氣質(zhì)、習(xí)慣等諸多差異，但歷史形成的慣性仍趨于一統(tǒng)卻是不爭的事實(shí)。武昌起義后，南方各省全線獨(dú)立，北方大體上仍在清廷控制之中，由此形成了政治地域上的“南方”、“北方”，軍事對立上的“南軍”、“北軍”，乃至政見上的“君憲”、“共和”之沖突。這種潛在的矛盾，即使在清帝退位后仍繼續(xù)存在，“定都之爭”乃至之后王芝祥的“督直之爭”（后敘），都是這種對立心態(tài)的延續(xù)性反映。

在此期間，南京臨時參議院更是演出了這樣一出活?。?月14日，議員們對定都南京一事舉行投票，結(jié)果出人意料，其中竟有20票主張建都北京，遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于孫中山所主張的建都南京[14]。時在總統(tǒng)府秘書處工作的吳玉章回憶說，這次投票，革命黨人占據(jù)多數(shù)，是完全可以根據(jù)孫中山的意見通過建都南京的決議的，不料當(dāng)天有個革命黨人李肇甫在會上大放厥詞[15]，說了一通遷都北京的必要，“結(jié)果贊成遷都北京的人便占了多數(shù)”。