李克農(nóng)到桂林后，立即開始對(duì)國民黨桂系的上層做聯(lián)絡(luò)工作，先是通過白崇禧的介紹，去拜會(huì)了廣西省長黃旭初。黃旭初對(duì)共產(chǎn)黨有戒心，問李克農(nóng)：“廣西有沒有共產(chǎn)黨？”李克農(nóng)坦誠地說：“當(dāng)然有，說沒有那是在騙你，我就是共產(chǎn)黨。不過我們共產(chǎn)黨不會(huì)找你的麻煩?！苯又羁宿r(nóng)又安排夏衍、徐特立去拜訪了黃旭初。共產(chǎn)黨的坦誠，使黃旭初最終打消了戒心。

11月下旬，八路軍在桂林設(shè)立辦事處。該辦事處得到了白崇禧的關(guān)照，工作開展得非常順利。辦事處為八路軍和新四軍籌措了大量緊缺軍用物資，也為延安輸送了大批愛國青年。李克農(nóng)還特別注意團(tuán)結(jié)國民黨民主派和桂系內(nèi)部的進(jìn)步人士，主動(dòng)與他們聯(lián)系，他和李濟(jì)深、李任仁、陳邵先等人，建立了很深的友情。

李濟(jì)深是國民黨元老，他利用自己職務(wù)的便利，為辦事處做了不少事。李克農(nóng)在桂林時(shí)，廣西大學(xué)學(xué)生鬧學(xué)潮，反對(duì)蔣介石的獨(dú)裁統(tǒng)治。廣西當(dāng)局逮捕了20多名學(xué)生，其中不少是中共地下黨員。李克農(nóng)請(qǐng)李濟(jì)深幫忙營救學(xué)生，李濟(jì)深讓秘書找到他在保定軍校時(shí)教過的學(xué)生黃旭初，黃旭初把學(xué)生全部釋放。

1941年國民黨掀起反共高潮，1月初制造震驚中外的“皖南事變”。國民黨特務(wù)要對(duì)廣西的八路軍辦事處人員和一些進(jìn)步民主人士下手，李克農(nóng)得到情報(bào)，特務(wù)要對(duì)夏衍下手，他通知夏衍馬上離開桂林。一天早上，李克農(nóng)接到要李濟(jì)深送來的一張小紙條，上面只有四個(gè)字“克農(nóng)快走”。李克農(nóng)知道，國民黨方面要對(duì)八路軍桂林辦事處動(dòng)手了。

李克農(nóng)當(dāng)機(jī)立斷，下令銷毀了一些機(jī)密文件，1月21日帶領(lǐng)辦事處的其他工作人員分別乘轎車和卡車，帶著物資向重慶撤離。在數(shù)位國民黨元老的壓力之下，特務(wù)不敢造次，桂系當(dāng)局執(zhí)行的是“禮送出境”政策，所以他們很快便離開廣西，進(jìn)入貴州。在貴陽他們?cè)獾絿顸h的刁難，幾經(jīng)周折到達(dá)重慶，從重慶再準(zhǔn)備去延安。