耶穌會士已經(jīng)嘗試過改變中國士大夫的信仰，到了日本他們就在武士身上下功夫。他們來到京都，得到了織田信長的賞識（他當(dāng)時致力于對抗比睿山的武士僧兵和位于大阪的凈土宗石山本愿寺）。葡萄牙人和基督教的事物流行起來。畫家創(chuàng)作了“南蠻的屏風(fēng)”來描繪葡萄牙人的“黑船”?；浇痰臉?biāo)志被用來裝飾漆盒和馬鞍。信長有時會穿戴葡萄牙服飾和十字架，還說如果耶穌會會士放棄一夫一妻的主張，他會考慮成為基督徒。皈依基督教的人從早年的寥寥幾個增加到1579年的13萬再到1600年的30萬。也就是說，在16世紀(jì)末期，日本基督徒的比例比現(xiàn)在還要高。

很難解釋為什么在這一時期，基督教在日本比在東亞其他地區(qū)更成功。當(dāng)基督教剛傳入的時候，日本人把它看作佛教的一個新教派。對日本人來說，真言宗的佛陀和基督教的上帝，阿彌陀佛的極樂世界和基督教的天堂，對著觀音（大慈大悲的女性菩薩）祈禱和對著圣母瑪利亞祈禱，這些幾乎沒有區(qū)別。日本人還注意到凈土宗與基督徒的信仰在神學(xué)上有相似性。在日本人看來，《羅馬書》①第十章提到“凡求告主名的，必將得救”，這令人想起凈土宗念阿彌陀佛的慣例。耶穌會會士也注意到了這些相似點，并且覺得這些教派是魔鬼創(chuàng)立來考驗他們的信仰。澤維爾是一個心胸狹隘的人，盡管他的苦行令人敬佩。他把歷史上的佛陀和阿彌陀佛歸類于“兩個魔鬼”。盡管他的排除異己導(dǎo)致了一些緊張和不滿，但基督教還是很快傳播開來，達(dá)到一個不小的規(guī)模，這些都是由于耶穌會會士個人魅力的緣故。