1929年6月，黃自放棄了美國錦繡的前程和優(yōu)裕的物質生活，在游歷了英、法、荷、意諸國后，于同年8月底帶著對音樂教育事業(yè)的滿腔熱忱回到了闊別5年的祖國，時年25歲?；貒?，黃自最初在上海滬江大學附屬中學擔任音樂教員。第二年，黃自接受了蕭友梅的邀請，擔任上海國立音專的教務主任和教員，當時的上海國立音樂?？茖W校剛剛改組，百廢待興，校長蕭友梅求賢若渴，急需主管教務的人才。最初蕭友梅本屬意好友青主，后來聽到黃自回國的消息便立即登門拜訪，破格任用了年輕有為的黃自，并且極為倚重。從此，黃自與上海音專結下了難解之緣。

音專草創(chuàng)時期，教務繁重，規(guī)章制度混亂，教員也嚴重不足。身為教務主任的黃自，不僅要處理瑣細的教務工作，還不得不承擔了大量的教學任務，獨當一面，工作極其繁忙。黃自的學生、上海音樂學院的老院長賀綠汀曾在回憶文章中寫道，“黃自先生以二十五歲的青年，在上海音專擔任繁重的教務工作外，還把全部理論作曲課包括共同課都由他一人包下，從初級和聲及鍵盤和聲、對位法、曲體學、配器法、音樂欣賞、音樂史一直到自由作曲他都教，他除了繁重的教學工作外，還從事各種音樂形式的音樂創(chuàng)作，甚至和他的學生共同編寫中小學音樂教科書，創(chuàng)造大型的合唱曲、愛國歌曲、藝術歌曲以及電影音樂?！蔽覀儾唤麨辄S自先生扎實的專業(yè)功底、充沛的精力、優(yōu)秀的行政能力、組織能力及他敏銳的創(chuàng)作才華而驚嘆！

身為名人，免不了會有一些流言，即使像黃自這樣謙虛謹慎的人也未能免俗，蕭黃矛盾之說便是如此。“樹欲靜而風不止”，蕭友梅與黃自，一個是上海國立音專的校長，一個是教務主任，是上海國立音專的兩大舉足輕重的人物。隨著音專的發(fā)展，二人矛盾之說卻愈演愈烈，特別是黃自因專心創(chuàng)作而辭去教務主任的職務后，一時甚囂塵上，連外國人都知道了。有的說是黃自有野心，要當音專的校長；有的說是蕭友梅拒不接受黃自提出的改革意見，以至黃自憤而辭去教務主任一職。那么蕭黃矛盾之說到底是怎么回事呢？我國著名的音樂史學家廖輔叔認為，兩人的矛盾更多的是由別人造成的，并舉例說：一次，黃自家里來了一位胡姓客人，稱會看相，接著講起自己看相的故事。夫人汪頤年聽得興起，想到蕭友梅常鬧病，年紀也大了，便問他對蕭先生的壽命如何估計？結果被有心人傳布，等蕭友梅聽說時，已經(jīng)被傳為：汪頤年問胡姓看相的蕭友梅什么時候死。類似的事件很多，“眾口鑠金，積毀銷骨”，謊言說多了，也便被當作了真理。大家也就都認為蕭黃二人有矛盾。其實，二人的關系頗為親密，蕭友梅可以說是黃自的伯樂。黃自逝世后，蕭友梅在寫給教育部的呈文中，還歷數(shù)了黃自對音專的貢獻，請求教育部準將黃自的薪水繼續(xù)發(fā)給黃自的家屬，直到聘書期滿為止。而黃自為人又是極謙虛的，平易近人，對學生都不會苛責，對蕭友梅更是尊重。“黃自有野心”一說根本是無稽之談，更何況，以黃自的能力和聲望，也不需如此，如果有，那也是對音樂的野心，對創(chuàng)作的野心！